Thèse soutenue

Caractérisation protéomique du matrisome des maladies des petits vaisseaux cérébraux par spectrométrie de masse

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Auteur / Autrice : Iman Haddad
Direction : Joëlle VinhAnne Joutel
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Chimie Analytique
Date : Soutenance le 03/12/2020
Etablissement(s) : Université Paris sciences et lettres
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Chimie physique et chimie analytique de Paris Centre (Paris ; 2000-....)
Partenaire(s) de recherche : établissement opérateur d'inscription : Ecole supérieure de physique et de chimie industrielles de la Ville de Paris (1882-....)
Laboratoire : Unité de Spectrométrie de Masse Biologique et Protéomique
Jury : Président / Présidente : Anne Varenne
Examinateurs / Examinatrices : Joëlle Vinh, Anne Varenne, Guillaume Van der Rest, Willy Vincent Bienvenut, Hugues Chabriat, Laurent Muller
Rapporteurs / Rapporteuses : Guillaume Van der Rest, Willy Vincent Bienvenut

Résumé

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Les maladies des petits vaisseaux cérébraux sont responsables de lésions de la substance blanche du cerveau et d'infarctus cérébrauxprofonds multiples. C'est un ensemble de processus pathologiques, qui affectent les petites artères, les artérioles, veinules oucapillaires cérébraux de moins de 400µm. Le matrisome cérébrovasculaire semble être une voie pathologique convergente entre lesdifférentes maladies des petits vaisseaux de type génétique et de type sporadique. La diversité structurale et physico-chimique desprotéines du matrisome rend cependant leur analyse particulièrement délicate. En effet, certaines protéines du core matrisome,protéines de haut poids moléculaire, sont particulièrement insolubles et d’autres protéines du matrisome associé sont généralementplus petites et moins abondantes. Dans le cadre de cette thèse nous nous proposons de caractériser de manière quantitative etqualitative le matrisome microvasculaire dans les maladies des petits de vaisseaux, ainsi que d'identifier des anomalies communes ouspécifiques à chaque maladie. Pour cela nous avons, dans un premier temps, développé une approche protéomique quantitative enspectrométrie de masse de type label-free sur des vaisseaux cérébraux et périphériques isolés, et nous l’avons validée dans unepremière étude sur un modèlemurin préclinique de CADASIL. Ensuite nous avons appliqué cette approche sur deux autres modèlesmurins pour les maladies génétiques CARASIL et la maladie du collagène de type IV, et deux modèles murins pour l'hypertensionetl'âge, modèle pour leur caractère sporadique. Nous avons développé et validé une nouvelle méthode robuste et sensible pourl’analyse quantitative sans marquage des changements du matrisome des artères cérébrales de souris. En effet, nous avons mis enévidence une protéine commune à toutes ces formes de cSVDs, PRSS23, une serine protéase dans les 5 modèles étudiée et HTRA1,une autre serine protéase, dans CADASIL, la maladie du collagène de type IV et l’âge.