Caractérisation de réseaux des gènes qui contrôlent l’initiation du fruit chez le melon (Cucumis melo)

Characterization of genes that control fruit initiation in melon (Cucumis melo)

• Auteur / Autrice : Afef Lemhemdi
• Direction : Adnane Boualem
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie
• Date : Soutenance le 06/02/2020
• Etablissement(s) : université Paris-Saclay
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences du végétal : du gène à l'écosystème (Orsay, Essonne ; 2015-....)
• Partenaire(s) de recherche : référent : Université Paris-Saclay. Faculté des sciences d’Orsay (Essonne ; 2020-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut des sciences des plantes de Paris-Saclay (Gif-sur-Yvette, Essonne ; 2015-....)
• Jury : Président / Présidente : Cécile Raynaud
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Mohammed Bendahmane, Ikram Blilou, Catherine Dogimont
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Mohammed Bendahmane, Ikram Blilou

Mots clés

Mots clés contrôlés

Melon

Cucurbitacées

Reproduction asexuée

Fruits

Fécondation

Pollinisation

Mots clés libres

Initiation du fruit

Parthénocarpie

Melon

Fruit initiation

Parthenocarpy

Melon

Résumé

Les analyses du profil d’expression par qRT-PCR des gènes candidats, ont montré que ARF19 a le profil le plus intéressant pour la parthénocarpie, chez le melon et le concombre. Ces analyses montrent aussi que la pollinisation induit, uniquement, l'expression de GA20oxydase(1) et le GA20oxydase(5). En absence de la pollinisation, presque tous les GA2oxydases sont exprimés. L’étude globale du transcriptome par RNA-seq a permis d’identifier des gènes qui pourraient avoir un rôle de régulateurs négatifs ou positifs dans l’initiation du fruit chez le melon. L’étude de la matrice des gènes liés à la division cellulaire montre que leur expression est élevée dans les ovules et le péricarpe à l’anthèse et au stade fécondé.Les données montrent aussi que le développement du fruit est régulé en grande partie par des facteurs de transcription. L'analyse génétique de phénotypage systématique a permis d’identifier FS1, le premier candidat pour la parthénocarpie facultative chez le melon.

Analyzes of candidates genes expression profile by qRT-PCR shown that ARF19 has the most interesting profile for parthenocarpy for melon and cucumber. These analyze show that the pollination induces the expression of GA20oxydase(1) and GA20oxydase(5). In the absence of pollination, almost all GA2oxydases are expressed. The study of the transcriptome by RNA-seq identifies genes which have a role of negative or positive regulators in the fruit initiation of melon. The study of genes matrix of cell division shows that their expression is high in ovules and pericarp at anthesis and fertilized stage. The data show that fruit development is largely regulated by transcription factors. Systematic phenotyping genetic analysis identified FS1 the first candidate for facultative parthenocarpy in melon.