Etude fonctionnelle des complexes coactivateurs SAGA et ATAC dans les cellules souches de souris

Functional study of the coactivator complexes SAGA and ATAC in mouse embryonic stem cells

• Auteur / Autrice : Véronique Fischer
• Direction : Laszlo Tora
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
• Date : Soutenance le 29/09/2020
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
• Jury : Président / Présidente : Patrick Schultz
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Laszlo Tora, Patrick Schultz, Mounia Lagha, Pablo Navarro Gil, Tineke Lenstra, Didier Devys
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Mounia Lagha, Pablo Navarro Gil

Mots clés

Mots clés contrôlés

Acétyltransférases

ARN polymérase II

Transcription génétique

Histones

Mots clés libres

Histone acétyltransférase

ATAC

SAGA

Cellules souches embryonnaires de souris

ARN Polymérase II

Histone acetyltransferase

ATAC

SAGA

Mouse embryonic stem cells

RNA polymerase II

Résumé

Des études récentes de mon laboratoire d’accueil indiquent que le complexe de modification des histones SAGA agit comme un cofacteur général pour la transcription par l’ARN polymérase II dans la levure, contrairement à sa fonction spécifique supposée précédemment. SAGA est évolutivement bien conservée, de la levure aux mammifères, et possède une fonction d’histone acétyltransférase (HAT). Chez les métazoaires, l’activité HAT de SAGA est partagée avec un autre complexe, le complexe ATAC. Des nouvelles approches m’ont permis de montrer qu’ATAC et SAGA ont des rôles cruciaux pour la maintenance de la pluripotence des cellules souches embryonnaires de souris. Des analyses d’ARN nouvellement-synthétises ont démontré que l’inactivation des complexes ATAC et SAGA modifient l’expression de groupes de gènes différents et aboutent à des phénotypes relativement différents dans ces cellules. Enfin, j’ai pu montrer que les anomalies transcriptionnelles et les phénotypes observé ne semble pas liées à l’activité HAT partagée entre ces deux complexes. Par conséquent, nos données indiquent que les complexes ATAC et SAGA ont des rôles importants et indépendants du HAT dans les cellules mammifères.

Recent studies from my host laboratory indicate that the histone modifying complex SAGA acts as a general cofactor for RNA polymerase II transcription in budding yeast in contrast to its previously assumed specific functions. SAGA is evolutionarily well conserved, from yeast to mammals, and has a histone acetyltransferase (HAT) function. In metazoans, the HAT activity of SAGA is shared with another complex, the ATAC complex. New approaches have allowed me to demonstrate that SAGA and ATAC have crucial roles in maintaining stemness of mouse embryonic stem cells. Newly synthesized RNA analyses revealed that inactivation of the SAGA and ATAC complexes influences the expression of different groups of genes and results in relatively distinct phenotypes in these cells. Finally, I was able to show that the transcriptional anomalies and the observed phenotypes do not seem to be linked to the HAT activity shared by these two complexes. Therefore, our data indicate that SAGA and ATAC have important, HAT-independent roles in mammalian cells.