Paludisme d'importation en France métropolitaine de 1996 à 2016 : le réseau de surveillance du CNR du paludisme et sa représentativité : évaluation et modélisation du risque de paludisme d’importation

Imported malaria in the mainland France from 1996 to 2016 : representativeness, assessment of the French National Reference Centre for malaria network and imported malaria risk modeling

• Auteur / Autrice : Eric Kendjo
• Direction : Renaud Piarroux, Marc Thellier
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Epidémiologie clinique
• Date : Soutenance le 18/12/2020
• Etablissement(s) : Sorbonne université
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Pierre Louis de santé publique : épidémiologie et sciences de l'information biomédicale (Paris ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre national de référence du paludisme pour la France métropolitaine (Paris)
• Jury : Président / Présidente : Olivier Bouchaud
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Peggy Gatignol
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Christophe Rapp, Françoise Benoît-Vical

Mots clés

Mots clés contrôlés

Indicateurs de santé

Veille sanitaire

Épidémiologie

France

Paludisme

Mots clés libres

Paludisme

Importation

Surveillance

Voyageurs

VFR

Capture-recapture

Malaria

Imported

Surveillance

Travellers

VFR

Capture-recapture

Résumé

La recrudescence des voyageurs vers les zones d'endémie palustre et le nombre élevé de cas importés ont accentué la nécessité de mettre en place une surveillance épidémiologique du paludisme. En dépit des mesures de prévention visant à réduire le risque d'infection chez les voyageurs, le nombre de cas de paludisme demeure élevé en France. Dans le cadre de la surveillance épidémiologique du paludisme, les cas rapportés en France pendant la période 1996-2016 ont été analysés et le système d'information et de surveillance du paludisme a été évalué. Une analyse des tendances épidémiologiques met en évidence les différents changements sur les caractéristiques épidémiologiques du paludisme en France au cours de deux dernières décennies. Une collaboration de recherche a été mise en place avec Santé publique France (SPF), l'Institut français de surveillance de la santé publique pour l’utilisation des données du registre national des causes de décès en médecine (CépiDc) et du Programme de Médicalisation du Système d’Information (PMSI) pour l’estimation du nombre de décès liés au paludisme en France. Nous avons utilisé les méthodes de capture-recapture à deux sources et les modèles log-linéaires pour estimer le nombre total de décès. Par ailleurs, de façon rétrospective, nous avons utilisé les données de trois enquêtes exhaustives sur le contrôle national de qualité en parasitologie pour estimer le nombre total des cas de paludisme en France. Il est ressorti de ce travail, que le système de surveillance du CNR du paludisme était stable au cours de la période d'étude, avec 85% des cas de paludisme rapportés au CNR du paludisme par 66 centres participants ayant déclaré constamment leurs cas au cours de la période d’étude, la sensibilité pour les décès était seulement de 38%, inférieure à celle des cas (52%). Sur le plan épidémiologique, les changements les plus frappants ont été l'augmentation de la proportion de cas de paludisme chez les individus d’origine africaine (de 53,5% en 1996 à 83,4% en 2016, la plupart des voyageurs qui visitent de la famille et des amis (VFR), 79,6% en 2016), une augmentation de l'âge médian des patients de +8 ans (africains, +10 ans et européens, +7 ans) et le doublement de la proportion de cas graves. En conclusion, ces changements dans les caractéristiques épidémiologiques des individus atteints de paludisme importé en France métropolitaine questionnent sur la stratégie actuelle de prévention pour les voyageurs. En termes de perspective, l’utilisation des enquêtes exhaustives et des méthodes de capture-recapture pourraient être des alternatives à des études longues et coûteuses permettant une évaluation quantitative des systèmes de surveillance, ainsi qu’une harmonisation des indicateurs de surveillance des maladies infectieuses en Europe.

Increase in travellers to malaria-endemic areas and the higher incidence of imported malaria cases have accentuated the need to set up an early warning system for malaria control. Despite prevention measures aimed at reducing the risk of infection among travellers, the number of malaria cases remains high in France. In that case, malaria cases reported in France from 1996 through 2016 were analyzed and the malaria information and surveillance system was evaluated. Interestingly, collaboration has been set up with Santé Publique France (SPF) for the use of data from the French National Registry on medical causes of death (CépiDc) and the French national hospital discharge database (PMSI) in regards to estimating the number of malaria-related deaths in France. This was done by using a two-source capture-recapture methods and log-linear models. In addition, retrospectively, we used the data from three exhaustive surveys based on questionnaire sent to all the medical laboratories belonging to the national quality control in parasitology in collaboration with the national Agency for the safety of Medical Products (ANSM) to estimate the total number of malaria cases in France. Then, we described trends in epidemiologic characteristic of imported malaria in France from 1996 to 2016. It emerged from this work that our surveillance system was stable during the study period, with 85% of malaria cases reported by 66 of participating centres having regularly declared their cases during the study period, the sensitivity for death was only 38%, poor compared to that of cases (52%). At the epidemiological level, the most striking changes were the increase in the proportion of malaria cases among African individuals (from 53.5% in 1996 to 83.4% in 2016, most of them African VFRs, to 79.6% in 2016), the 8-year increase of the median age of the patients (African, 10 years and European, 7 years) and the doubling in the proportion of severe cases. What we have learned from this study is that these changes in the epidemiological characteristics of individuals suffering from malaria should imply a strengthening of malaria preventive strategy to alleviate the burden of the disease among travellers in France. In the last two decades, substantial progress has been made to enhance malaria surveillance in France by providing appropriate diagnostics and treatments, enhancing the French malaria surveillance system. In this situation, the excellent quality of the data, the sensibility of the captures, the stability of the network, and the large contribution of the correspondents to malaria network are useful as they allow validating results on a large scale. In perspective, the use of national surveys and capture-recapture methods could be alternatives to long and costly studies allowing a quantitative evaluation of surveillance systems and harmonisation of indicators for infectious diseases control in Europe. Furthermore, reducing the cost of malaria prophylaxis and national preventive campaign toward population at risk are essential to continue the downward trend of imported malaria incidence in France.