Caractérisation immunologique des réservoirs des virus de l’immunodéficience humaine VIH-2 et VIH-1 dans les cellules immunocompétentes et étude des paramètres de l’immunité innée et intrinsèque

par Mariama Sadjo Diallo

Thèse de doctorat en Immunologie

Sous la direction de Brigitte Autran.

Soutenue le 29-06-2020

à Sorbonne université , dans le cadre de École doctorale physiologie, physiopathologie et thérapeutique , en partenariat avec Centre d'immunologie et des maladies infectieuses (Paris ; 2014-....) (laboratoire) .

Le président du jury était Stéphanie Graff-Dubois.

Le jury était composé de Delphine Sauce, Mohamed Cisse.

Les rapporteurs étaient Laurence Weiss, Guislaine Carcelain.

mots clés

• VIH-2
• VIH-1
• Lymphocytes T CD4
• Réservoirs
• Inductibilité
• Corécepteurs
• Facteurs de transcription
• Cellules NK
• NKp30
• Cellules T auxiliaires
• VIH (virus)
• Cellules NK
• Infections à VIH
• Cellules suppressives
• Immunité cellulaire
• Facteurs de transcription

Résumé

Les VIH-2 et VIH-1 diffèrent par leur pathogénicité. Pour mieux comprendre les mécanismes de faible pathogénicité et de réplication du VIH-2, nous avons étudié les caractéristiques immuno-virologiques des réservoirs du VIH-2 chez des patients VIH-2+ (ANRS-CO-05). Quatorze sujets VIH-2+ ont été comparés à des donneurs sains. Les cellules sanguines ont été triées en sept sous-populations (monocytes, T CD4 activés et au repos (TN, TCM, TTM, TEM)). L’ADN du VIH-2 a été quantifié par PCR et détecté chez 4 sujets : dans les TTM et les TCM mais pas dans les monocytes. L’analyse phénotypique des cellules NK a été réalisée par cytométrie en flux (24 sujets, ANRS-CO-05). Les cellules NK des VIH-2+ avaient : une expression de NKp30 diminuée, une augmentation de la production d'IFN-g et une altération de la fonction cytolytique en présence de B7-H6, comparés aux VIH-1+. L’expression des corécepteurs et des facteurs de transcription a été analysée, montrant des niveaux plus élevés chez les VIH-1 LTNP comparée aux VIH-2+, et aux donneurs sains pour la plupart des paramètres. Nous avons observé que l’expression de PD1 était plus importante sur les T CD4 des VIH-1 LTNP comparés aux donneurs sains. Nous avons montré que les faibles réservoirs du VIH-2 se distinguent des réservoirs du VIH-1 par l'absence d'infection monocytaire et par une infection limitée des TCM.

mots clés

• HIV-2
• HIV-1
• CD4 T cells
• Reservoirs
• Inducibility
• Coreceptor
• Transcription factor
• NK T cells
• NKp30

Titre traduit

Immunological characterization of HIV-2 and HIV-1 human immunodeficiency virus reservoirs in immunocompetent cells and study of innate and intrinsic immunity parameters

Résumé

HIV-2 and HIV-1 differ in pathogenicity. To better understand the mechanisms of HIV- 2 low pathogenicity and replication potential, we studied immune and virologic characteristics of HIV-2 reservoirs of infected patients (cohort ANRS CO-05). Fourteen HIV-2+ subjects from the ANRS CO-05 cohort were compared to healthy donors. Seven peripheral blood sub-populations were sorted by flow cytometry : Monocytes, activated and resting CD4 T cells (TN, TCM, TTM, TEM). Viral DNA was quantified in sorted cells by PCR. HIV-2 DNA was detected in TTM and TCM sub-populations of 4 patients but not in monocytes. The phenotype of peripheral NK cells was analyzed by flow cytometry (24 HIV-2 ANRS CO-05 cohort). HIV-2+ patients had lower proportions of NKp30+ NK cells, increased production of IFN-g and altered cytolytic function in the presence B7-H6 surface ligand, when compared to HIV-1+. The analysis of HIV-1 and HIV-2 co-receptors and transcription factors expression showed higher values in HIV-1LTNP (ANRS CO15) cohort, compared to HIV-2+ and healthy donors. We also found that the PD1 expression by CD4 T cells was higher in HIV-1LTNP subjects compared to healthy donors, though not correlated to the HIV-1 plasma load. Her we show that HIV-2 reservoirs are distinct from the HIV-1 reservoirs by the absence of monocytic infection and a limited TCM infection.