Thèse soutenue

Décodage des communications et interactions entre cellules immunitaires à l’aide d’approches dites 'cellules-uniques’
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Auteur / Autrice : Pierre Bost
Direction : Benno SchwikowskiIdo Amit
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie
Date : Soutenance le 07/10/2020
Etablissement(s) : Sorbonne université
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Complexité du vivant (Paris)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut Pasteur (Paris). Biologie systémique
Jury : Président / Présidente : Sonia Garel
Examinateurs / Examinatrices : Leïla Perié, Thomas Walter
Rapporteurs / Rapporteuses : Sten Linnarsson, Martin Guilliams

Résumé

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Les communications cellulaires sont indispensables au bon fonctionnement des organismes multicellulaires, notamment pour s’adapter à un environnement changeant en permanence. Les cellules du système immunitaire n’échappent pas à cette règle mais les interactions entre cellules immunitaires restent peu connues et compliquée à étudier. La récente apparition des technologies de séquençage dites ‘cellules uniques’ représente une opportunité unique pour étudier ces communications. Dans cette thèse, différentes approches expérimentales et analytiques ont été développées pour étudier ces communications à une échelle de cellules uniques. Ces stratégies ont ensuite été appliquées à différents contextes pathologiques, incluant le COVID-19, la maladie d’Alzheimer ou une immunisation par des pathogènes inactivés, et ont permis d’identifier des voies de communications cellulaires jusqu’ici inconnues ou mal comprises. Néanmoins, l’efficacité de ces approches est limitée par l’absence d’informations sur la localisation des cellules et des travaux supplémentaires intégrant ce genre de données est essentiel pour aller plus loin dans la dissection des communications entre cellules immunitaires.