Biogéographie de deux espèces de tortues d'eau douce ( Emys orbicularis et Mauremys leprosa) en Tunisie, diversité génétique des hémoparasites et risque d'introduction parasitaire

Biogeography of two freshwater turtle species (Emys orbicularis and Mauremys leprosa) in Tunisia and genetic diversity of their haemoparasites

• Auteur / Autrice : Rahma Attia El Hili
• Direction : Olivier Verneau, Mohamed Sghaier Achouri
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie
• Date : Soutenance le 05/10/2020
• Etablissement(s) : Perpignan en cotutelle avec Université de Tunis El Manar
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Énergie environnement (Perpignan ; 1999-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre de Formation et de recherche sur les environnements méditerranéens (Perpignan) - Laboratoire Diversité, gestion et conservation des systèmes biologiques (Tétouan)
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Irène Landau, Imed Jiribi, Jérôme Boissier, Faouzia Charfi-Cheikhrouha
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Irène Landau, Imed Jiribi

Mots clés

Mots clés contrôlés

Variabilité génétique

Tortues d'eau douce

Tunisie

Cistude d'Europe

Mots clés libres

Tortues d'eau douce

Tunisie

Distribution

Hémogregarines

18S rARN

Coi

Emyde lépreuse

Cistude d’Europe

Freshwater turtles

Tunisia

Distribution

Hemogregarines

18S rRNA

Coi

The European pond turtle

The Mediterranean pond turtle

Résumé

Cette étude a pour objectifs d’actualiser les données sur la répartition et la variation génétique des deux espèces de tortues d’eau douce Mauremys leprosa et Emys orbicularis en Tunisie et d’évaluer leur vulnérabilité. Elle a également pour but de déterminer la diversité et d’évaluer la spécificité des hémogrégarines (Protozoa: Apicomplexa: Haemogregarinidae) en se basant sur les analyses morphologiques et moléculaires. L’Emyde lépreuse n’est actuellement pas menacée en Tunisie contrairement à la Cistude d’Europe qui est en situation critique. Les analyses morphologiques et moléculaires des parasites sanguins ont permis de montrer la présence de co-infection chez un même individu de tortue. L’aspect moléculaire a concerné la caractérisation et l’identification des espèces appartenant au même genre Haemogregarina à travers l’utilisation des marqueurs mitochondriaux et nucléaires. Ainsi on a pu comparer le degré d’informations génétiques des deux marqueurs et de montrer que le gène mitochondrial COI permettait d’identifier plus de variabilité que celle trouvée avec le gène 18S ARNr. En outre, la faible spécificité de ces parasites sanguins envers les espèces hôtes définitives et intermédiaires, s’est révélée un facteur qui augmente le risque de transmission des hémogregarines d’une espèce hôte exotique vers une espèce hôte indigène.

The objective of this study is to update data on distribution and genetic variation of t two species of freshwater turtles Mauremys leprosa and Emys orbicularis in Tunisia and to assess their vulnerability. It also aims to determine the diversity and to evaluate the specificity of the hemogregarins (Protozoa: Apicomplexa: Haemogregarinidae) based on morphological and molecular analyzes. The Mediterranean pond turtle is currently not threatened in Tunisia unlike the European pond turtle which is in critical situation. Morphological and molecular analyzes of blood parasites have reveald the presence of co-infection in the same turtle specimen. The molecular aspect concerned the characterization and identification of species belonging to the same genus Haemogregarina through the use of mitochondrial and nuclear markers. Thus we were able to compare the level of genetic information of the two markers and to demonstrat that the mitochondrial COI genes identified more variability than those found with the 18S rRNA gene. In addition, the low specificity of these blood parasites towards the final and intermediate host species has been shown to be a factor which increases the risk of transmission of hemogregarins from an exotic host species to a native host species.