Applications de l'imagerie à l'étude de la barrière intestinale et de son microenvironnement dans les états inflammatoires digestifs

Applications of imaging to the study of the intestinal barrier and its microenvironment in digestive inflammatory states

• Auteur / Autrice : Lucille Quénéhervé
• Direction : Emmanuel Coron, Michel Neunlist
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie, médecine et santé
• Date : Soutenance le 18/09/2020
• Etablissement(s) : Nantes
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Biologie-Santé (Nantes)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : The Enteric Nervous System in Gut and Brain Disorders (Nantes)
• Jury : Président / Présidente : Gabriel Rahmi
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Céline Boisseau Bossard
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Geoffroy Vanbiervliet, Xavier Dray

Mots clés

Mots clés contrôlés

Tomographie en cohérence optique

Rejet de greffe

Maladies inflammatoires chroniques de l'intestin

Appareil digestif

Endoscopie

Mots clés libres

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Résumé

L'étude du remodelage de la barrière digestive et de son micro environnement au cours de pathologies d'intérêt en s'appuyant sur l'utilisation ou le développement de techniques endoscopiques innovantes pourrait permettre d'identifier des paramètres à visée diagnostique ou pronostique dans ces pathologies. La première étude rapportée dans ce travail a permis de définir des paramètres morphologiques quantitatifs pour caractériser la muqueuse colique en endomicroscopie confocale. Ces données ont permis de créer un score pour le diagnostic de maladie inflammatoire chronique intestinale et un autre score pour le diagnostic de rectocolite hémorragique par rapport à la maladie de Crohn. La seconde étude s'est intéressée au remodelage de la muqueuse colique après allogreffe de moelle hématopoïétique, à travers notamment l'analyse des paramètres d'endomicroscopie confocale mis en évidence au cours de la première étude. Cette étude a permis de montrer des modifications de la taille et de la forme des cryptes après allogreffe par rapport à des contrôles, sans retrouver de facteurs prédictifs de développement de maladie de greffon contre l'hôte. La troisième étude a démontré la faisabilité de l'analyse des structures muqueuses au sein de biopsies endoscopiques standard en tomographie par cohérence optique plein champ, une technique d'imagerie nouvelle caractérisée par une résolution de l'ordre de 1 μmet la possibilité de distinguer les structures cellulaires et du micro environnement en fonction de leurs «micro mouvements ».

The study of the remodeling of the digestive barrier and its microenvironment during pathologies of interest using innovative endoscopic techniques could enable to identify diagnostic or prognostic biomarkers in these pathologies. The first study reported in this work enabled to define quantitative morphological parameters to characterize the colonic mucosa in confocal endomicroscopy. We created a score for the diagnosis of inflammatory bowel disease and another score for the diagnosis of ulcerative colitis or Crohn's disease. The second study aimed to study the remodeling of the colonic mucosa after allogeneic hematopoietic stem cells transplantation, notably through the analysis of confocal endomicroscopy parameters highlighted during the first study. This study showed changes in the size and shape of the crypts after allograft compared to controls, without finding predictive factors for the development of graft versus host disease. The third study showed the feasibility of the analysis of the mucosa! structures within standard endoscopic biopsies in full field optical coherence tomography, a new imaging technique characterized by a resolution of about 1 μm and the possibility to distinguish cellular and microenvironmental structures according to their ''micromovements''.