Thèse soutenue

Modélisation de la dynamique de population en présence d'hybridation
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Auteur / Autrice : Nina Santostasi
Direction : Olivier GimenezPaolo Ciucci
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Ecologie et Biodiversité
Date : Soutenance le 18/02/2020
Etablissement(s) : Montpellier en cotutelle avec Università degli studi La Sapienza (Rome)
Ecole(s) doctorale(s) : GAIA (Montpellier ; École Doctorale ; 2015-...)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre d'écologie fonctionnelle et évolutive (Montpellier)
Jury : Président / Présidente : Emmanuelle Cam
Examinateurs / Examinatrices : Olivier Gimenez, Paolo Ciucci, Emmanuelle Cam, Guillaume Chapron, John F. Benson, Gentile-Francesco Ficetola
Rapporteurs / Rapporteuses : Guillaume Chapron, John F. Benson

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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Dans le premier chapitre, nous avons développé un modèle pour estimer la prévalence dans les populations animaux, réalisé une étude de simulation pour évaluer les performances du modèle, les comparer à des quantifications naïves de la prévalence et évaluer l'exactitude des estimations de la prévalence dans différents scénarios d'échantillonnage. Les principaux résultats de ce chapitre étaient que la prévalence des hybrides pouvait être estimée, la prévalence basée sur le modèle avait systématiquement de meilleures performances que la prévalence naïve. Nos résultats soulignent l'importance d'une approche basée sur un modèle pour obtenir des estimations précises de la prévalence de différents segments de la population. Dans le deuxième chapitre, nous estimé la prévalence des hybrides chiens-loups dans une population locale et protégée de loups dans le nord des Apennins, en Italie. Nous discutons des résultats à la lumière de l'évaluation précédente de la prévalence des hybrides loup x chien en Europe occidentale et nous illustrons les implications des résultats pour la conservation et la gestion du loup dans les paysages dominés par l'homme. En particulier, nous avons estimé 64 à 78% d'hybrides récents survenant dans 6 des 7 meutes étudiés. Nos résultats soulignent que dans les paysages modifiés par l'homme, l'hybridation chien-loup peut atteindre des niveaux inattendus si elle n'est pas gérée et que les barrières reproductives ou la dilution des gènes des chiens par rétro-croisement ne devraient pas, en soi, empêcher la survenue et la propagation de l'introgression.Dans le troisième chapitre, nous présentons un nouveau modèle matriciel de population pour projeter la dynamique de population des populations animales en présence d'hybridation. Nous appliquons le modèle à deux études de cas du monde réel d'espèces de mammifères terrestres (loup x chien) et marins (dauphin commun Delphinus delphis x dauphin bleu et blanc Stenella coeruleoalba). Nos projections ont mis en évidence que l'hybridation conduit à l'extinction génomique en l'absence d'isolement reproductif, les espèces rares ou épuisées sont particulièrement vulnérables à l'extinction génomique, l'extinction génomique dépend principalement des paramètres démographiques des espèces parentales, du maintien en bonne santé et abondant les populations empêchent l'extinction génomique.Dans le quatrième chapitre, nous avons construit un modèle individuel décrivant le cycle de vie du loup gris en envisageant des traits de dynamique sociale liés aux taux d'hybridation. Nous avons appliqué ce modèle pour étudier la dynamique d'hybridation des loups dans une population d'étude des Apennins du Nord, en Italie, afin d'évaluer l'efficacité de différents scénarios de gestion visant à réduire l'abondance des individus mélangés pendant une période de dix générations. Nous avons montré qu'en présence d'une immigration continue des hybrides, toute mesure de gestion s'est révélée inefficace. En présence d'immigration de loups purs, toutes les mesures de gestion ont entraîné une diminution de la prévalence bien que leur efficacité relative ait changé en fonction du scénario de choix d'accouplement. Dans tous les scénarios simulés, l'impact de l'hybridation devrait s'étendre à grande échelle à mesure que de nombreux disperseurs hybrides sont produits. De plus, nous avons identifié des processus démographiques et sociaux qui doivent être approfondis pour projeter plus précisément les résultats des alternatives de gestion.