Physiologie et génétique de la dynamique des réserves corporelles des ovins allaitants dans un milieu contraignant

Physiology and genetic of body reserves dynamic for meat sheep in a constraint environment

• Auteur / Autrice : Tiphaine Mace
• Direction : Carole Moreno-Romieux, Dominique Hazard
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Pathologie, Toxicologie, Génétique et Nutrition
• Date : Soutenance le 28/09/2020
• Etablissement(s) : Toulouse, INPT
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences écologiques, vétérinaires, agronomiques et bioingénieries (Toulouse)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Génétique Physiologie et Systèmes d'Élevage (Castanet-Tolosan, Haute-Garonne ; 2014-....)
• Jury : Président / Présidente : Catherine Larzul
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Carole Moreno-Romieux, Dominique Hazard, Nicolas Friggens, Gilles Renand, Anne de La Torre Capitan, Eliel Gonzalez-Garcia
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Nicolas Friggens, Gilles Renand

Mots clés

Mots clés contrôlés

Bétail -- Alimentation

Génétique animale

Brebis

Mots clés libres

Brebis Romane

Capacité adaptative

Paramètres génétiques

Analyses longitudinales

Adaptive capacity

Genetic parameters

Longitudinal analysis

Romane ewes

Résumé

Depuis quelques années, l’élevage doit répondre à de nouvelles contraintes liées au changement climatique et adopter des principes proposés par l’agroécologie pour assurer sa durabilité. L’utilisation d’animaux plus robustes peut permettre de répondre à ces nouveaux défis. Une des composantes de cette robustesse est la dynamique des réserves corporelles (DRC ; alternance de périodes de mobilisation (MO) et de reconstitution (RE) des RC). Ce mécanisme biologique permet aux ruminants de faire face aux périodes avec un bilan énergétique négatif (BEN). L’objectif de ma thèse est d’approfondir les connaissances sur ce sujet en caractérisant la DRC au cours de plusieurs cycles de production et en étudiant le déterminisme génétique de cette dynamique chez les ovins allaitants. Les données utilisées proviennent de suivis longitudinaux d’état corporel et de poids vif de brebis allaitantes Romane, élevées en plein air intégral à La Fage (Causses du Larzac). La caractérisation de la DRC indique qu’il existe plusieurs grands types de trajectoires de variation d’état corporel au cours des stades physiologiques des brebis. Les différences de niveau et de forme de ces trajectoires s’expliquent principalement par de la variabilité interindividuelle. La modélisation mathématique de la DRC a permis de définir des critères synthétiques des capacités de MO et RE des RC. Par ailleurs, de faibles corrélations, mais favorables, entre la DRC et d’autres performances de production indiquent que plus la brebis mobilise ses RC durant les périodes de BEN, meilleures sont les performances de production. L’étude du déterminisme génétique de la DRC a permis de mettre en évidence qu’il s’agit d’un caractère héritable et que les mécanismes de MO et RE des RC sont fortement liés génétiquement. Le nombre élevé et les faibles effets des zones du génome associées à la DRC suggèrent un déterminisme polygénique. Enfin, de nombreux gènes candidats ont été identifiés dans ces régions génomiques déjà décrits pour leurs liens avec des caractères d’adiposité, de croissance et les métabolismes énergétique. Ainsi, l’utilisation de la DRC en sélection génétique peut être envisagée chez les ruminants, même si des travaux complémentaires doivent être poursuivis notamment par l’étude des interactions génotype x milieu sur ce caractère.

During the last few years, livestock keepers had to respond to new constrains linked to the climate change and to adopt principles proposed by agroecology to ensure their sustainability. The use of more robust animals can allow responding to these new challenges. One component of this robustness is the body reserves’ dynamic (BRD; i.e. alternation of BR mobilization (MO) and accretion (AC) periods). Such mechanism allows the ruminants to cope with negative energy balances (NEB). My thesis objective is to get new insights in such a complex subject, through an effort looking to deep BRD characterization during several production cycles while investigating the related genetic determinism of this trait in meat ewes. The data used come from longitudinal measurements of body weight and body condition score of Romane meat ewes reared under the extensive rangeland conditions of La Fage (Causses du Larzac). Characterization of BRD showed the existence of several trajectories describing body condition changes throughout ewe’s physiological stages. Differences in the level and shape of trajectories were mainly due to interindividual variability. Modelling of BRD produced few synthetic criteria for estimation of individual capacity of BR MO and AC. In addition, low but favorable correlations between BRD traits and ewes production performances indicated that more ewes will mobilize their BR, better their production performance will be. The genetic determinism study demonstrated that BRD traits are heritable and BR MO and AC processes are genetically linked. High number and small effects of QTLs associated to BRD traits suggest a polygenic determinism. Finally, several candidate genes were identified in the QTL regions, which have been previously described to be related to fat traits, growth traits or energy metabolism. The use of BRD in genetic selection may be considered in ruminants, even if complementary works must be performed, particularly with the genotype x environment study on this trait.