L’abeille domestique, Apis mellifera, est un pollinisateur qui joue un rôle économique et écologique majeur. Les pertes de colonies d’abeilles observées depuis quelques décennies seraient le reflet d’un déclin plus global des pollinisateurs. Ce déclin aurait une origine multicausale, impliquant de nombreux facteurs de stress potentiellement capables d’interagir entre eux. Ce travail s’intéresse à l’impact de deux facteurs de stress auxquels l’abeille est fréquemment exposée : le parasite microsporidien Nosema ceranae et les insecticides neurotoxiques (substances actives ou formulations phytopharmaceutiques), ainsi qu’à leurs interactions. Un effet synergique sur la mortalité des abeilles a été observé avec certaines combinaisons. N. ceranae et les insecticides ont également induit une modulation d’activités enzymatiques et du transcriptome de l’intestin moyen de l’abeille, avec des gènes impliqués dans l’immunité, la détoxication, l’intégrité épithéliale et neuronale et le cycle cellulaire. L’association Nosema-insecticide a spécifiquement induit une modulation de gènes du système ubiquitine-protéasome et de la phosphorylation oxydative. En outre, une perturbation des espèces bactériennes majoritaires du microbiote intestinal a été mise en évidence en réponse à ces facteurs de stress. Ces travaux ont ainsi démontré des interactions entre deux insecticides et entre parasite et insecticide, et proposent des hypothèses sur le mode d’action de ces interactions qui restent à vérifier à l’échelle individuelle et de la colonie.