Acceptabilité des auto-prélèvements vaginaux et leur application à la recherche des causes infectieuses d'avortement en milieux ruraux au Sénégal

Acceptability of vaginal self-sampling and its application to the search for infectious causes of abortion in rural areas in Senegal

• Auteur / Autrice : Ndeye Safietou Fall
• Direction : Jean-Christophe Lagier, Cheikh Sadibou Sokhna
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie santé. Maladies infectieuses
• Date : Soutenance le 26/11/2020
• Etablissement(s) : Aix-Marseille en cotutelle avec Université Cheikh Anta Diop de Dakar. Faculté mixte de médecine et de pharmacie (1960-....)
• Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Sciences de la vie et de la santé (Marseille)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Méditerranée Infection
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Vitrome (Marseille) - Institut de recherche pour le développement (France). Centre de Hann (Dakar, Sénégal)
• Jury : Président / Présidente : Florence Fenollar
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Makhtar Camara
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Michel Carles, Patricia Renesto

Mots clés

Mots clés contrôlés

Papillomavirus humains

Vaginose bactérienne

Biologie moléculaire

Organes génitaux femelles -- Infections

Mortalité maternelle

Mots clés libres

Auto-Prélèvement

Vaginal

Sénégal

Rural

Self-Sampling

Vaginal

Senegal

Rural

Résumé

Au Sénégal, la mortalité maternel est et demeure élevée au cours de cette dernière. L’avortement spontané, touchant environ 10% des grossesses, est une interruption prématurée et involontaire de la grossesse. En milieux ruraux, il est difficile d’en identifier les causes réelles à cause des limites d’accès aux soins. Cependant, avec l’utilisation de la technique auto-prélèvement vaginal pour le diagnostic des infections génitales a démontré son efficacité dans la détection de plusieurs maladies.Dans notre travail, nous avons utilisé la technique d’auto-prélèvement vaginal pour l’échantillonnage. La biologie moléculaire a été utilisé pour une étude épidémiologique de certaines maladies, la culturomics effectuée sur des échantillons présentant ou non la vaginose bactérienne. Nous avons pu montrer que l’auto-prélèvement vaginal avait une bonne faisabilité et une bonne acceptabilité en déterminant le portage de HPV sur des auto-prélèvements vaginaux réalisés chez des sujets apparemment sains. Sur les 136 femmes qui se sont présentées aux postes 134 (98,5 %) ont réalisé correctement les prélèvements. Cela nous a permis de mettre en évidence la présence d’HPV ( 10% des femmes , 6% de HPV Haut risque et 4 % HPV bas risque). De même, nous avons utilisé l’auto-prélèvement vaginal dans la détection de cause de fausse couche ou d’autres problème de grossesse dans une zone plus large. Cela nous a permis de mettre en évidence Listeria monocytogénes et pour une première fois, la présence de Borrelia crocidurae dans le vagin de femmes ayant fait une fausse couche. La culturomics nous a permis de mettre en évidence 5 nouvelles espèces bactériennes.

In Senegal, the maternal mortality rate remains high and has remained almost the same over the past decade. Spontaneous abortion, which affects about 10% of diagnosed pregnancies, corresponds to a premature and involuntary termination of pregnancy. In rural areas, it is difficult to identify the real causes of these abortions because of the limits of access to care. This for, the use of vaginal self-sampling for the detection of genital infections in women has proven effective in the diagnosis of several diseases.A molecular biology tools (qPCR, PCR, sequencing, ...) have been used on these samples for an epidemiological study of disease. Likewise, culturomics was performed on a few samples based on the presence or absence of bacterial vaginosis.We have shown that self-sampling Vaginal had a good feasibility and good acceptablité (98.5% turnout equals) in rural areas in Senegal in determining the carrying on vaginal HPV self-sampling performed in apparently healthy subjects. Of the 136 women who presented themselves to the posts, 134 performed the samples correctly. This allowed us to highlight the presence of HPV (10% of women, 6% of high risk HPV and 4% low risk HPV) in these women. Similarly, we used the vaginal self-sampling in the detection due to miscarriage or other pregnancy problem in a wider area. This allowed us to demonstrate, for the first time, the presence of Borrelia crocidurae in the vagina. Our results also showed the presence of Listeria monocytogenes in the vagina of two women who had a miscarriage. The culturomics allowed us to identify 5 new bacterial species