Thèse soutenue

Caractérisation structurelle de nucléoprotéines remarquables et développement d'inhibiteurs contre les nucléases de mammarenavirus
FR  |  
EN
Accès à la thèse
Auteur / Autrice : Thi Hong Van Nguyen
Direction : François-Patrice FerronNathalie Chazal
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biochimie
Date : Soutenance le 10/12/2020
Etablissement(s) : Aix-Marseille
Ecole(s) doctorale(s) : Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques (AFMB) (Marseille)
Fondation : Méditerranée Infection
Jury : Président / Présidente : Jean-Claude Guillemot
Examinateurs / Examinatrices : Niki Vassilaki
Rapporteurs / Rapporteuses : Abuhammad Areej, Julien Lescar

Résumé

FR  |  
EN

Mon travail porte sur l’étude structurale des nucléoprotéines (NPs) virales d’Arenavirus et du MERS-CoV, développement d’une stratégie thérapeutique contre de l'Exo-NP et l'Endo d’Arénaviridae. Les NPs sont impliquées dans la protection, la compaction du génome viral. Si chez les virus à ARN négatif, NP fait partie du complexe de réplication, sa présence est exceptionnelle chez les virus à ARN positif et est par contre courante chez les Coronavirus. NPs polymérisent au contact de l’ARN génomique. Après, j’ai réalisé une analyse exhaustive des NPs d’Arenaviridae et de Bunyavirales, et j’ai proposé un mécanisme universel de polymérisation par extension de «bras», puis j'ai caractérisé structure du domaine de la NP du MERS-CoV. Dans un deuxième temps, j'ai developé d’inhibiteurs des nucléases. Chez les Arenaviridae, Exo-NP est impliqué dans le mécanisme d’évasion de l’immunité innée; Endo de la protéine L est impliqué dans le mécanisme de vol de coiffe. 2 nucléases bien que structuralement différentes possèdent le même mécanisme catalytique moléculaire à 2 ions métalliques. La stratégie est l’identification de molécules ciblant le site catalytique par arrimage par les ions, leur déplétion. À l’aide d’une approche par screening virtuelle, cristallographie, caractérisation enzymatique, j'ai identifié une molécule, et en caractériser l’inhibition sur l’Exo-NP et validé la stratégie. Mais la molécule testée ayant montré une toxicité en cellules infectées, il n’a pas été poursuivi. J’ai appliqué cette approche sur une bibliothèque des composés sur l’Exo-NP et sur l’Endo, j’ai identifié des molécules pour le développement d’inhibiteurs contre les nucléases des Mammarénaviruses.