Thèse soutenue

Dissection de la réponse coordonnée de l'interféron par des éléments promoteurs avec une activité enhancer
FR  |  
EN
Accès à la thèse
Auteur / Autrice : David De Santiago Algarra
Direction : Salvatore Spicuglia
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Génomique et Bioinformatique
Date : Soutenance le 10/12/2020
Etablissement(s) : Aix-Marseille
Ecole(s) doctorale(s) : Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Théories et approches de la complexité génomique (TAGC) (Marseille)
Jury : Président / Présidente : Jean-Christophe Andrau
Examinateurs / Examinatrices : Sandrine Sarrazin
Rapporteurs / Rapporteuses : Gioacchino Natoli, Suzanne Mandrup

Résumé

FR  |  
EN

L'expression génique est contrôlée par l'implication des éléments régulateurs du gène proximal (promoteurs) et distal (enhancer). Des résultats antérieurs ont démontré qu'un sous-ensemble de promoteurs de gènes, également appelés Epromoteurs, fonctionne comme des enhancers de bona fide et régule l'expression distale des gènes. Nous avons émis l'hypothèse que les Epromoteurs pourraient jouer un rôle clé dans la coordination de l'induction rapide des gènes dans la réponse au stress, en particulier pendant l'inflammation. En utilisant un test de reporter à haut débit, nous avons exploré la fonction d'Epromoter en réponse à l'interféron de type I. Nous avons constaté que les facteurs de transcription STAT1/STAT2 et IRF se lient préférentiellement aux Epromoteurs induits par l'IFNa et régulent de manière distale l'activation des gènes de réponse à l'interféron. Des observations similaires ont été faites dans d'autres types de réponse inflammatoire. Nos résultats suggèrent que les Epromoteurs pourraient fonctionner comme une plaque tournante pour recruter les TF clés nécessaires à la régulation coordonnée des grappes de gènes pendant la réponse inflammatoire, et plus généralement sur la réponse cellulaire aux signaux intra et extracellulaires.