Approche transdisciplinaire du diagnostic des pathogènes anciens

Transdisciplinary approach to the diagnosis of ancient pathogens

• Auteur / Autrice : Rémi Barbieri
• Direction : Michel Drancourt, Michel Signoli
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie santé. Microbiologie
• Date : Soutenance le 27/11/2020
• Etablissement(s) : Aix-Marseille
• Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Sciences de la vie et de la santé (Marseille)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Anthropologie bio-culturelle, droit, éthique et santé (Marseille) - Méditerranée Infection
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Mephi (Marseille)
• Jury : Président / Présidente : Gérard Aboudharam
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Michel Signoli, Isabelle Prêcheur-Sablayrolles
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Hélène Coqueugniot, Marie-Cécile Ploy

Mots clés

Mots clés contrôlés

Épidémies

Paléomicrobiologie

Paléopathologie

Maladies infectieuses

ADN fossile

Mots clés libres

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Résumé

L’étude et la compréhension des épidémies anciennes est un champ disciplinaire en pleine expansion grâce aux nouveaux outils de détection de l’ADN ancien. Les maladies infectieuses coexistant avec l’Homme ont toujours été à l’origine de bouleversements historiques. La compréhension des sources et de la dynamique des épidémies anciennes résulte principalement d’études transdisciplinaires mêlant histoire, paléopathologie et paléomicrobiologie. Au cours de ce travail de Thèse, avons pût élucider le mystère de la mort du Caravage (1610) et la cause de la mort de Soldat Américain (1861) et Français (16ème siècle). Concernant les sources et les dynamiques des épidémies de peste anciennes. Nos résultats ont tout d’abord permis de renforcer l’hypothèse du sol salé et aride comme réservoir ultime de Y. pestis aux USA et de mieux appréhender le schéma de transmission de la peste Médiévale.

The study and understanding of ancient epidemics is a emerging disciplinary field thanks to new tools for detecting ancient DNA. Infectious diseases coexisting with humans have always been the source of historical changes. Understanding the sources and dynamics of ancient epidemics results mainly from transdisciplinary studies combining history, paleopathology and paleomicrobiology. During this Thesis work, we elucidate the mystery of the death of Caravaggio (1610) and the cause of the death of American (1861) and French Soldiers (16th century). Regarding the sources and dynamics of ancient plague epidemics. Our results confirm the hypothesis of saline and arid soil as the ultimate reservoir of Y. pestis in the US and allow to better understand the transmission pattern of the Medieval plague.