Thèse soutenue

Rôle des protéines réticulantes de l'actine dans la mécanique de l'endocytose chez la levure
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Auteur / Autrice : Mohamed Reda Belbahri
Direction : Alphée MichelotOlivia Du RoureJulien Heuvingh
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biochimie structurale
Date : Soutenance le 10/09/2020
Etablissement(s) : Aix-Marseille
Ecole(s) doctorale(s) : Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM) - Physique et mécanique des milieux hétérogènes (Paris ; 1997-....)
Jury : Président / Présidente : Sylvie Hénon
Examinateurs / Examinatrices : Serge Dmitrieff
Rapporteurs / Rapporteuses : Isabelle Sagot

Résumé

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L'objet de cette thèse porte sur l'étude du rôle des protéines réticulantes dans la génération de force des réseaux d'actine branchés lors de l'endocytose. Une première étape consiste en une quantification in-vivo de la dynamique des patchs d'endocytose dans des levures (S. cerevisiae) sauvages et dans des levures mutantes n'exprimant pas une ou plusieurs protéines réticulantes. En mettant ces résultats en parallèle avec des données mécaniques déjà établies par une ancienne doctorante, nous avons pu démontrer une corrélation entre l'élasticité d'un réseau d'actine et l'efficacité de l'endocytose. Cette étude, publiée en 2019, nous proposons une chaîne de causalité pour expliquer les phénotypes observés.En parallèle de ces travaux, et à partir d'une technique élaborée au PMMH, j'ai travaillé sur le développement d'un outil de mesure de la mécanique et de la rhéologie de gels d'actine in-vitro : les micro-cylindres magnétiques. Avec cet outil et l'expertise de l'IBDM sur les extraits cellulaires, j'ai pu analyser la rhéologie des gels d'actine reconstitués à partir d'extraits cellulaires de levure comportant (ou pas) les agents réticulants. La rhéologie de ces gels d'actine semble être un élément de plus en plus important à considérer pour expliquer l'efficacité de l'endocytose.La comparaison des résultats in vivo et in vitro nous a permis de déterminer l’effet des protéines de réticulations sur ces gels, d’observer des corrélations entre certains paramètres mécaniques et l’efficacité de l’endocytose dans la cellule et enfin de mieux comprendre le rôle des réseaux d’actine dans la génération de force durant l’endocytose.