La bioluminescence bactérienne, des océans à Biolum-Archi : un phénomène biologique fascinant au service d'un modèle d'habitat durable méditerranéen?

Bacterial bioluminescence, from oceans to Biolum-Archi : a fascinating phenomenon at the service of a mediterranean-sustainable-habitat model ?

• Auteur / Autrice : Lisa Tanet
• Direction : Christian Tamburini, Laurie Casalot
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Océanographie
• Date : Soutenance le 07/05/2020
• Etablissement(s) : Aix-Marseille
• Ecole(s) doctorale(s) : Ecole doctorale Sciences de l'Environnement (Aix-en-Provence ; 1996-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut méditerranéen d'océanologie (Marseille ; Toulon ; 2012-....) - Institut de recherche pour le développement (France ; 1998-....)
• Jury : Président / Présidente : Patricia Bonin
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Urania Christaki
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Jérôme Mallefet, Marcel Hubert Marie Koken

Mots clés

Mots clés contrôlés

Vibrio harveyi

Bactéries

Biotechnologie

Bioluminescence

Mots clés libres

Bioluminescence

Bactéries

Photobacterium

Biotechnologies

Bioluminescence

Bacteria

Photobacterium

Applied technology

Résumé

La bioluminescence, production de lumière visible par des organismes vivants, est un phénomène fascinant, en particulier chez les bactéries qui l’émettent de façon continue. Pour ce projet interdisciplinaire, ces travaux de thèse ont mêlé recherche fondamentale et appliquée, et se sont articulés autour de la problématique suivante : la bioluminescence bactérienne peut-elle être mise au service d’un modèle d’habitat durable ?Ce manuscrit se compose (i) d’un premier chapitre introductif sur le phénomène de bioluminescence, intégrant notamment une synthèse bibliographique sur l’importance écologique des bactéries bioluminescentes dans le milieu marin ; (ii) d’un second chapitre montrant que les gènes impliqués dans la bioluminescence ne sont pas toujours régulés par le quorum sensing ; (iii) d’un troisième chapitre se focalisant sur les effets de l’oxygène sur la physiologie de la souche modèle (iv) d’un quatrième chapitre regroupant les informations relatives à une application de la bioluminescence bactérienne et les prototypes développés au cours de cette thèse. Dans ce dernier chapitre, les avantages, ainsi que les limites actuelles, de l’utilisation de la bioluminescence comme source d’éclairage sont énoncés. Les résultats obtenus au cours de ces trois années ont mis en avant des premiers éléments de réponse et ont permis d’acquérir de nouvelles connaissances sur la souche utilisée, et sur les bactéries bioluminescentes d’une façon générale. Ces travaux visent à être poursuivis et approfondis par d’autres recherches, davantage encore axées vers un objectif pratique et appliqué de la bioluminescence.

Bioluminescence, the emission of light by living organisms, is a fascinating phenomenon, especially in bacteria that emit it continuously.For this interdisciplinary project, this thesis work mixed fundamental and applied research, and was structured around the following problem: can bacterial bioluminescence be used at the service of a sustainable-habitat model? This manuscript is composed of (i) a first introductory chapter on the bioluminescence phenomenon, including a bibliographical synthesis on the ecological importance of bioluminescent bacteria in the marine environment; (ii) a second chapter showing that the genes involved in bioluminescence are not, in P. photobacterium ANT-2200, under quorum sensing control; (iii) a third chapter focusing on the effects of oxygen on the physiology of the model strain through the use of an semi-automated culture platform allowing controlled and regulated conditionsb; (iv) a fourth chapter gathering information relating to an application of bacterial bioluminescence and the prototypes developed during this thesis. In this last chapter, the advantages, as well as the current limitations, of the use of bioluminescence as a source of illumination are stated. The results obtained during these three years have highlighted initial elements of response and have led to new knowledge on the used strain, and on bioluminescent bacteria in general. This work is intended to be continued and deepened by further research, even more focused on the practical and applied objective of bioluminescence.