Recherche de nouveaux tests rapides en cytométrie en flux pour l’établissement de diagnostics « aux lits des patients » : application à la discrimination des infections bactériennes et/ou virales en vue de réduire l’usage inutile des antibiotiques

Research of new rapid flow cytometry tests for ''bedside'' diagnosis : application to the discrimination between bacterial and/or viral infections in order to reduce unnecessary antibiotic use

• Auteur / Autrice : Pénélope Bourgoin
• Direction : Pierre-Emmanuel Morange, Fabrice Malergue
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Immunologie
• Date : Soutenance le 13/02/2020
• Etablissement(s) : Aix-Marseille
• Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre de recherche en cardiovasculaire et nutrition (C2VN)
• Partenaire(s) de recherche : Entreprise : Immunotech-Beckman Coulter
• Jury : Président / Présidente : Philippe Naquet
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Philippe Naquet, Mikaël Roussel, Jacques Levraut
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Mikaël Roussel, Jacques Levraut

Mots clés

Mots clés contrôlés

Cytométrie en flux

Marqueurs biologiques

Maladies infectieuses

Immunologie

Mots clés libres

Cytométrie en flux

Immunologie

Pathologies infectieuses

Diagnostic au lit du patient

Flow cytometry

Immunology

Infectious diseases

Point-Of-Care diagnosis

Résumé

Les maladies infectieuses sont des pathologies dont le diagnostic étiologique est souvent complexe. Le clinicien doit baser son diagnostic sur ses observations cliniques et les relier aux mesures biologiques du patient. Plusieurs groupes recherchent activement de nouveaux marqueurs biologiques pour préciser ce diagnostic. C’est dans cette optique que la cytométrie en flux a été utilisée et optimisée pour comparer l’expression de nouveaux biomarqueurs sur les cellules du sang des patients infectés ou des sujets sains. La caractérisation des mécanismes d’expression des marqueurs montre que l’expression du CD64 sur les neutrophiles est amplifiée chez les patients infectés par une bactérie via l’interféron γ, alors que l’expression du CD169 sur les monocytes est amplifiée chez les patients infectés par un virus via la famille des interférons de type I (α, β, ω). De plus, l’expression de l’HLA-DR sur les monocytes semble aider à l’identification étiologique de l’infection. Les travaux suggèrent que le dosage de ces trois biomarqueurs par la technique de cytométrie en flux optimisée pourrait être un candidat intéressant dans les études sur le diagnostic des infections bactériennes et virales.

Infectious diseases are pathologies whose etiological diagnosis is often complex. The clinician must base his diagnosis on his clinical observations and link them to the patient's biological measurements. Several groups are actively seeking new biomarkers to clarify this diagnosis. It is for this purpose that flow cytometry has been used and optimized to compare the expression of new biomarkers on blood cells of infected patients or healthy subjects. Characterization of the expression mechanisms of the markers shows that the expression of CD64 on neutrophils is amplified in patients infected by a bacterium via interferon γ, whereas the expression of CD169 on monocytes is amplified in patients infected with a virus via the type I interferon family (α, β, ω). In addition, the expression of HLA-DR on monocytes seems to help the etiological identification of the infection. The work suggests that the assay of these three biomarkers combined into an optimized flow cytometry technique could be an interesting candidate in studies on the diagnosis of bacterial and viral infections.