Thèse soutenue

Etude du quorum sensing des bactéries organisées en biofilm en vue de la mise en place des biocides non toxiques
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Auteur / Autrice : Emmanuel Gozoua
Direction : Yves BlacheRose Amenan Koffi-Névry
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Date : Soutenance le 04/06/2019
Etablissement(s) : Toulon en cotutelle avec Université Nangui Abrogoua (Abidjan)
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Mer et Sciences. ED 548 (Toulon)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire Matériaux Polymères Interfaces Environnement Marin (MAPIEM). EA 4323 (Toulon)
Jury : Examinateurs / Examinatrices : Rose Amenan Koffi-Névry, Philippe Michaud, Chantal Iobbi-Nivol, Jean-Michel Bolla, Claudine Baraquet, Maëlle Molmeret

Résumé

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Le biofouling est un phénomène invasif qui engendre des problèmes économiques et écologiques importants. Dans ce mode de vie privilégié, les micro-organismes communiquent grâce à un système de communication intra- et inter-espèces, voire inter-genre, appelé quorum sensing (QS). Le QS est basé sur les petites molécules diffusibles telles que les N-acyl homosérine lactones (AHL), et est donc impliqué dans de nombreux processus physiologiques, notamment la production de facteurs de virulence, l'émission de bioluminescence et la production de pigments. Dans une étude antérieure, le QS a été mis en évidence chez une bactérie marine dénommée Pseudoalteromonas ulvae TC14 isolée de la rade de Toulon. P. ulvae TC14 étant non seulement capable de produire un biofilm important et de la violacéine mais régulerait ces deux paramètres (biofilm et violacéine) par la détection d' AHLs exogènes car elle n'en produirait pas. Cette étude a consisté dans un premier temps à poursuivre la caractérisation du système QS chez P. ulvae TC 14 par une étude moléculaire. Tout en vérifiant l'absence de synthase d' AHL (Luxl) et des gènes potentiels de l'auto-induction de type 2 (AI-2) chez P. ulvae TC14, la présence de huit séquences régulatrices luxR a pu être détectée et une évaluation de l'expression de ces séquences a été faite par technique RT q-PCR. Dans le but de déterminer l'impact de la modulation du QS sur l'adhésion et la formation du biofilm chez P. ulvae TC 14 des molécules régulatrices du QS ont été testées en combinaison avec trois analogues synthétiques à effet antifouling. La restauration de l'adhésion et de la formation du biofilm par les molécules combinées a montré que la modulation du QS chez P. ulvae TC14 ne semble pas être la voie privilégiée pour l'inhibition du biofilm. Cependant l'évaluation d'autres cibles telles que la membrane bactérienne et les pompes d'efflux à travers des perméabilisants membranaires et les inhibiteurs de pompes d' efflux a montré un effet synergique sur l'adhésion et la formation du biofilm. Ainsi, la perméabilisation membranaire et l'inhibition des pompes d'efflux semblent être des meilleures voies de potentialisation de l'effet antifouling des analogues synthétiques