Thèse soutenue

Élucidation de l'architecture génétique des traits dans une population naturelle de levures
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Auteur / Autrice : Téo Fournier
Direction : Joseph SchachererJacky de Montigny
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
Date : Soutenance le 27/09/2019
Etablissement(s) : Strasbourg
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Génétique moléculaire, génomique et microbiologie (Strasbourg)
Jury : Président / Présidente : Bernard Dujon
Examinateurs / Examinatrices : Joseph Schacherer, Jacky de Montigny, Bernard Dujon, Christian R. Landry, Matthew V. Rockman, Stéphanie Blandin
Rapporteurs / Rapporteuses : Christian R. Landry, Matthew V. Rockman

Résumé

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Comprendre les règles contrôlant la diversité entre individus issus d’une même population est l’un des points centraux de la biologie moderne. Récemment, l'avènement des études d’association pan-génomique a permis de lier le génotype au phénotype au sein de populations. Cependant, une part importante de la variance phénotypique reste inexpliquée et est appelée héritabilité manquante. En combinant le modèle d’étude Saccharomyces cerevisiae, un design emprunté à la génétique classique et des stratégies de phénotypage et de génotypage à haut-débit, ce travail a pour objectif d’élargir notre compréhension des causes de cette héritabilité manquante à l’échelle de l’espèce. Nous avons donc pu quantifier l’impact des variants rares, obtenir une image globale du spectre de la complexité génétique des phénotypes ainsi que mesurer l’impact du fonds génétique sur cette complexité. Enfin, grâce à des techniques de séquençage utilisant de longs fragments d’ADN, une solide base pour l'identification de variants structuraux dans des populations naturelles de levures a été bâtie, permettant d’obtenir une première vue des effets phénotypiques de tels variants.