Inhibition traductionnelle du facteur de restriction APOBEC3G par la protéine Vif du VIH-1 : rôle d'une uORF dans la 5'-UTR de l'ARNm d'A3G et identification de facteurs cellulaires

Translational inhibition of the restriction factor APOBEC3G (A3G) by the HIV-1 Vif protein : role of a uORF in the 5'-UTR of A3G mRNA and identification of cellular factors

• Auteur / Autrice : Tanja Seissler
• Direction : Jean-Christophe Paillart
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Virologie : aspects moléculaires et médicaux
• Date : Soutenance le 13/09/2019
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Architecture et réactivité de l'ARN (Strasbourg ; 1992-....)
• Jury : Président / Présidente : David Gilmer
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Jean-Christophe Paillart, David Gilmer, Sarah Gallois-Montbrun, Caroline Goujon, Emiliano Ricci
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Sarah Gallois-Montbrun, Caroline Goujon

Mots clés

Mots clés contrôlés

Produits du gène vif du virus de l'immunodéficience humaine

Protéines -- Modifications posttraductionnelles

Protéines virales

Maladies -- Aspect moléculaire

VIH (virus)

Mots clés libres

APOBEC3G

VIH

Vif

UORF

Traduction

Interaction ARN-protéine

Pull-down d'ARN

APOBEC3G

HIV

Vif

UORF

Translation

RNA-protein interaction

RNA pull-down

Résumé

La protéine Vif du VIH-1 contrecarre le facteur de restriction APOBEC3G (A3G) en diminuant son niveau d'expression dans les cellules infectées. Ceci est mis en œuvre entre autres par l'inhibition de sa traduction, un mécanisme encore peu compris. La première partie de ma thèse contribue à la caractérisation d'une petite ORF (uORF) qui se situe dans la 5'-UTR de l'ARNm d'A3G et d'A3F en amont de leurs ORF respectives. Cette uORF s'est révélée cruciale pour la régulation de la traduction d'A3G en présence et absence de Vif. Dans la deuxième partie de cette thèse, différents protocoles ont été mis en œuvre pour identifier les protéines associées avec l'ARNm d'A3G, qui pourraient jouer un rôle dans le mécanisme d'inhibition traductionnelle d'A3G par Vif. Ainsi, plusieurs protéines ont été identifiées dont la présence sur l'ARNm d'A3G semble modulée par Vif.

The HIV-1 Vif protein counteracts the restriction factor APOBEC3G (A3G) by downregulating its expression level in infected cells. This is achieved in different ways, one of which is translational inhibition, a mechanism that is still poorly understood. The first part of my thesis contributes to the characterization of a small upstream ORF (uORF), that is found in the 5'-UTR of A3G and A3F mRNAs. This uORF has been found to be crucial for regulation of A3G translation and is necessary to allow Vif-mediated translational inhibition. In the second part of this thesis, different protocols have been set up in order to identify A3G mRNA-associated cellular proteins which might play a role in the mechanism of Vif-mediated translational inhibition. Several proteins, whose presence on A3G mRNA seems to be modulated by Vif have been identified.