Rôle de la protéine ribosomale RACK1 dans la régulation de la traduction

Role of the ribosomal protein RACK1 in translation regulation

• Auteur / Autrice : Evelyne Einhorn
• Direction : Jean-Luc Imler
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
• Date : Soutenance le 18/06/2019
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Modèles Insectes de l'Immunité Innée (Strasbourg)
• Jury : Président / Présidente : Serge Potier
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Jean-Luc Imler, Serge Potier, Zoya Ignatova, Nicola Gray, Carine Meignin, Rénald Delanoue
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Zoya Ignatova, Nicola Gray

Mots clés

Mots clés contrôlés

Récepteurs de kinase-C activée

Protéines ribosomiques

Site d'entrée interne des ribosomes

Récepteurs

Protéine kinase C

Génétique virale

Mots clés libres

RACK1

IRES

Traduction sélective

Stress

Drosophila melanogaster

RACK1

IRES

Selective translation

Stress

Drosophila melanogaster

Résumé

RACK1 (Receptor for activated protein C kinase 1) est une protéine ribosomale associée à de nombreuses voies de signalisation. RACK1 est nécessaire à la traduction sélective de virus contenant des sites d’entrée interne du ribosome (IRES). En outre, l’expression de RACK1 est nécessaire au cours du développement, suggérant que ce facteur participe à la traduction de certains ARNm cellulaires. Dans le but de mieux comprendre la fonction de RACK1 chez la drosophile, j’ai au cours de ma thèse caractérisé l’interactome de RACK1 et un IRES viral régulé par ce facteur. J’ai également essayé d’établir un lien entre signalisation cellulaire et traduction, et montré que la région du knob est importante pour la fonction de RACK1 au ribosome. Enfin, j’ai établi que RACK1 est nécessaire à la réponse à des stress abiotiques, et identifié les gènes cellulaires régulés par RACK1 dans ce contexte. J’ai en particulier découvert que RACK1 était un régulateur négatif de l’expression de plusieurs gènes de l’immunité innée. Mes résultats suggèrent que RACK1 joue un rôle pivot au sein du ribosome, régulant la traduction de façon positive ou négative selon l’ARNm et le contexte cellulaire.

RACK1 (Receptor for activated protein C kinase 1) is a ribosomal protein associated to many signaling pathways. RACK1 is required for the selective translation of viruses containing internal ribosome entry sites (IRES). In addition, expression of RACK1 is necessary during development, suggesting that it regulates the translation of cellular mRNAs. In order to better understand the function of RACK1 in Drosophila, I have participated in the characterization of the RACK1 interactome and of a RACK1-dependent viral IRES. I have also attempted to establish a connection between the function of RACK1 in signaling and in translation, and I have shown that the knob domain of RACK1 is important for IRES-dependent translation. Finally, I have established that RACK1 is required for the response to abiotic stresses, and I have identified cellular genes regulated by RACK1 in this context. In particular, I discovered that RACK1 is a negative regulator of several innate immunity genes. My results suggest that RACK1 plays a pivotal role within the ribosome, regulating translation positively or negatively in an mRNA- and possibly context-specific manner.