Le couplage des cycles du carbone et du fer dans l'océan Austral au travers du métabolisme microbien

The coupling of carbon and iron cycles in the Southern Ocean through microbial metabolism

• Auteur / Autrice : Pavla Debeljak
• Direction : Ingrid Obernosterer, Gerhard Herndl
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Océanographie microbienne
• Date : Soutenance le 18/10/2019
• Etablissement(s) : Sorbonne université
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de l'environnement d'Île-de-France (Paris ; 1992-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire d'océanographie microbienne (Banyuls-sur-Mer, Pyrénées-Orientales ; 1997-....)
• Jury : Président / Présidente : Gwenaël Piganeau
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Géraldine Sarthou, Loïs Maignien
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : María Vila Costa, David L. Kirchman

Mots clés

Mots clés contrôlés

Eau -- Teneur en carbone

Cycle du carbone

Effets du fer

Procaryotes

Austral, Océan

Phytoplancton marin

Mots clés libres

Omics

Expression génétique

Océan austral

Océanographie microbienne

Communautés microbiennes

Séquençage

Fer

Carbone

Omics

Gene expression

Southern Ocean

Microbial oceanography

Microbial communities

Sequences

Iron

Carbon

Résumé

L'océan Austral est caractérisé par l’acronyme anglais (HNLC) signifiant qu’il contient des concentrations en nutriments élevées, mais que la biomasse phytoplanctonique y est faible. Cette situation paradoxale est due à la limitation du phytoplancton par le fer (Fe). L'augmentation de la biomasse phytoplanctonique en réponse à l'apport de Fe et, par conséquent, une plus grande absorption de dioxyde de carbone (CO2), a été démontrée dans plusieurs expériences de fertilisation artificielle et dans des régions naturellement fertilisées de l'océan Austral. Cependant, l'impact de Fe sur les procaryotes marins, acteurs clés du cycle du carbone marin, reste mal compris. En plus du Fe, les concentrations de carbone organique dissous (COD) sont faibles dans les eaux de surface de l'océan Austral, ce qui entraîne une double limitation pour l’activité et de la croissance des procaryotes hétérotrophes. Pour mieux comprendre le rôle des différents taxons procaryotes dans les cycles de Fe et de C, plusieurs aspects ont été pris en compte dans la thèse actuelle. Les résultats présentés dans cette thèse fournissent de nouvelles perspectives sur le lien entre les divers taxons microbiens et leur rôle dans le cycle du Fe- et du C dans l'océan Austral.

The Southern Ocean is known as a High Nutrient Low Chlorophyll (HNLC) region where major nutrients are present at high concentrations, but phytoplankton biomass remains low. This paradoxical situation is due to iron (Fe) limitation of phytoplankton growth. The increase in phytoplankton biomass in response to Fe input and the consequently higher uptake of carbon dioxide (CO2) were demonstrated in several artificial fertilization experiments and in naturally fertilized regions of the Southern Ocean. However, the impact of Fe on marine prokaryotes, key players in the marine carbon cycle, remains poorly understood. In addition to Fe, concentrations of dissolved organic carbon (DOC) are low in surface waters of the Southern Ocean, leading to a double constraint of microbial heterotrophic activity and growth. To better understand the role of different prokaryotic taxa in the Fe- and C-cycles, several aspects were considered in the present thesis. The results presented in this thesis provide novel insights on the link between diverse microbial taxa and their role in the Fe- and C-cycling in the Southern Ocean.