Thèse soutenue

Déterminants environnementaux de la distribution des Culicoides (Diptera ˸ Ceratopogonidae), moucherons vecteurs de virus animaux d'intérêt économique, au Maroc

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Auteur / Autrice : Maria Bourquia
Direction : Claire GarrosKhalid Khallaayoune
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie des populations et écologie
Date : Soutenance le 24/10/2019
Etablissement(s) : Montpellier, SupAgro en cotutelle avec Institut agronomique et vétérinaire Hassan II (Maroc)
Ecole(s) doctorale(s) : Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : ASTRE - Animal, Santé, Territoires, Risques et Ecosystèmes
Jury : Président / Présidente : Ghita Chlyeh
Examinateurs / Examinatrices : Claire Garros, Khalid Khallaayoune, Mohammed Fekhaoui, Philippe Jacquiet, Jérôme Depaquit
Rapporteurs / Rapporteuses : Mohammed Fekhaoui, Philippe Jacquiet, Jérôme Depaquit

Résumé

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Les Culicoides sont de petits moucherons piqueurs hématophages, appartenant à la famille des Ceratopogonidae, le genre est présent sur toutes les surfaces terrestres, à l'exception de l'Antarctique. Une très faible proportion de la diversité du genre Culicoides a un rôle épidémiologique avec un impact significatif sur la santé humaine et animale. En effet, un certain nombre d'espèces est connu pour être des espèces impliquées dans la transmission biologique de virus, de protozoaires et d'helminthes. L'importance des Culicoides tient surtout à leur capacité à transmettre le virus de la fièvre catarrhale ovine et le virus de la peste équine, qui ont, par le passé, provoqué des épizooties massives, à l'origine par exemple à la fin des années 1950 de la mort de 180 000 moutons dans le sud de la Péninsule ibérique et de 300 000 chevaux au Proche et Moyen-Orient. De plus, certaines espèces ont un comportement mammophile et sont des nuisances importantes pour les activités humaines de tourisme ou d'agroforesterie et harassent les animaux d'élevage (dermatite estivale récidivante chez les chevaux). Malgré cette importance vétérinaire les Culicoides restent un groupe de diptères peu étudié. Dans le but de mieux comprendre la distribution des Culicoides au Maroc, pays qui a connu des épizooties de fièvre catarrhale ovine et de peste équine, notre travail de thèse aborde à travers 3 volets la caractérisation des facteurs environnementaux déterminant l'abondance des espèces. Le premier volet s'intéresse à la révision taxonomique de la diversité des espèces de Culicoides présente au Maroc avec une approche morphologique et moléculaire. Ce travail a permis la mise à jour de la liste d'espèces de Culicoides présentes au Maroc, de confirmer la présence d'au moins huit espèces vectrices -avérées ou potentielles- des virus de la fièvre catarrhale ovine (endémique depuis 2004), de la peste équine (éradiqué grâce à la vaccination, mais avec un risque de réintroduction) et de la maladie hémorragique épizootique (EHDV) (absent depuis 2006). Cette étude a aussi recensée pour la première fois 4 espèces nouvelles pour la faune marocaine, à savoir Culicoides paolae, Culicoides subfagineus, Culicoides achrayi et Culicoides haranti.Le second volet a s'attache à caractériser la diversité et la saisonnalité des espèces de Culicoides d'intérêt vétérinaire dans différents environnement d'élevage (bovin, ovin, équin). Nos résultats montrent que la diversité spécifique est la même quel que soit le type d'élevage, mais qu'elle varie significativement selon la saison. Des variations de l'abondance et de sa dynamique sont observées entre les espèces, tout en étant caractéristique du régime saisonnier du climat méditerranéen. L'impact des paramètres environnementaux, qui peuvent être à l'origine de l'abondance des Culicoides, a été étudié, remettant en question le rôle potentiel de la pression atmosphérique. Le dernier volet s'est intéressé à la détermination de la distribution spatiale des Culicoides à l'échelle nationale, ce qui nous a permit d'obtenir des cartes d'abondance pour les principales espèces recensées et de caractériser les facteurs environnementaux expliquant leur abondance à différentes échelles spatiales. Ce qui servira dans le futur à cartographier le risque de transmission des virus qui sont associés aux espèces vectrices de Culicoides. De telles cartes de risque sont importantes pour cibler les actions de surveillance et de lutte dans une perspective d'améliorer le rapport coût/bénéfice de ces programmes.