Décodage de l'impact des séquences de promoteurs sur la dynamique transcriptionnelle in vivo
Auteur / Autrice : | Kervy Carola Fernandez Oliveros |
Direction : | Mounia Lagha |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Biologie Santé |
Date : | Soutenance le 04/12/2019 |
Etablissement(s) : | Montpellier |
Ecole(s) doctorale(s) : | Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé (Montpellier ; Ecole Doctorale ; 2015-....) |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier |
Jury : | Examinateurs / Examinatrices : Mounia Lagha, François Payre, Nathalie Dostatni, Ferenc Mueller, Eugénia Basyuk |
Rapporteurs / Rapporteuses : François Payre, Nathalie Dostatni |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Résumé
La transcription chez les eucaryotes est un processus très complexe qui nécessite une coordination précise entre les éléments trans-régulateurs et séquences cis-régulatrices nécessaires à la transcription. En utilisant des méthodes quantitatives d'imagerie in vivo, combinées à un modèle mathématique de déconvolution, nous évaluons l'influence des séquences promotrices minimales (entre -50 ;+50) sur la dynamique de transcription in vivo.La manipulation de la boîte TATA du promoteur minimal transgénique snail, montre que la TATA box affecte la synchronie de l’activation transcriptionnelle et le pourcentage d’activation. Bien qu’une mutation drastique de la TATA conduise à une diminution significative du pourcentage de noyaux actives, l'activité du promoteur n’est pas abolie. Suggérant un potentiel inhérent de ce promoteur pour encourager la transcription. En revanche les mutations effectues sur le INR motif du promoteur transgénique krüppel n’affectent pas la synchronie, ni le pourcentage d’activation, mais semblent plutôt affecter la force d’activité du promoteur. Ceci suggère que la séquence promotrice joue un rôle central dans la régulation de la transcription, et que potentiellement la composition en éléments promoteurs pourrait jouer un rôle clé dans l’adaptation du control transcriptional dans un contexte génomique particulier.