Thèse soutenue

Comment faciliter l'identification de l'entomofaune ? : Construction, évaluation et amélioration de clés d'identification numériques

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Auteur / Autrice : Mathilde Delaunay
Direction : Régine Vignes-LebbeRomain Nattier
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Ecologie et Biodiversité
Date : Soutenance le 10/05/2019
Etablissement(s) : Paris, Muséum national d'histoire naturelle
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la nature et de l'Homme - Évolution et écologie (Paris ; 1995-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de systématique, évolution, biodiversité (Paris ; 2009-....)
Jury : Président / Présidente : Jean-Yves Dubuisson
Examinateurs / Examinatrices : Régine Vignes-Lebbe, Romain Nattier, Jean-Yves Dubuisson, Emmanuel Castella, Jean-Nicolas Beisel, Laure Turcati, Isabelle Dajoz, Marie Charpin
Rapporteur / Rapporteuse : Emmanuel Castella, Jean-Nicolas Beisel

Résumé

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Les clés d’identification numériques représentent des outils efficaces pour identifier les êtres vivants, et sont également utilisées dans le cadre de programmes de sciences participatives. Accessible en ligne, la plateforme Xper3 permet de créer des bases de données de biodiversité et de générer des clés d’identification interactives. Ce travail de thèse a testé diverses approches dans l’objectif de faciliter l’identification de l’entomofaune de France, en particulier de groupes d’insectes vivant dans des milieux menacés, ou ayant une importance écologique et patrimoniale notable : les coccinelles et quatre ordres d’insectes aquatiques (odonates, éphémères, plécoptères et coléoptères), aux stades larvaires et adultes. Nous avons créé pour ces groupes sept clés d’identification numériques fiables, intuitives et accessibles à tous les publics, disponibles à l’adresse web suivante : infosyslab.fr/?q=fr/node/113. Grâce au système Xperience permettant d’enregistrer le détail des identifications réalisées par les utilisateurs des clés Xper3, nous avons testé l’utilisation de notre clé des larves d’odonates et celle de la clé ‘’Insectes’’ du programme de sciences participatives Spipoll sur les insectes pollinisateurs. Nous avons ainsi pu mieux comprendre comment ces clés numériques sont utilisées et quels problèmes sont rencontrés par leurs utilisateurs. Des pistes d’amélioration ont été proposées pour rendre les clés d’identification plus efficaces et faciles à prendre en main. Le travail réalisé dans cette thèse a également montré que la précision des clés d’identification augmente avec l’intégration de critères écologiques en sus des caractères morpho-anatomiques. Cet ajout est particulièrement pertinent pour les jeunes larves d’insectes aquatiques, qui peuvent ne pas être identifiables à l’espèce avec les données morpho-anatomiques seules.