Thèse soutenue

Sources de variation de la forme des otolithes : Implications pour la discrimination des stocks de poissons
FR  |  
EN
Accès à la thèse
Auteur / Autrice : Kélig Mahé
Direction : Hélène de PontualRachid Amara
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : AGRONOMIE, PRODUCTIONS ANIMALE ET VEGETALE, AGROALIMENTAIRE, Biologie de l’environnement, des populations, écologie
Date : Soutenance le 05/12/2019
Etablissement(s) : Littoral
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la matière, du rayonnement et de l'environnement (Villeneuve d'Ascq, Nord)
Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Unité de recherche Recherches et Développements Technologiques (Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer)
Laboratoire : Laboratoire Ressources halieutiques Manche Mer du nord, IFREMER Centre Manche Mer du Nord
Jury : Président / Présidente : Mireille Harmelin-Vivien
Examinateurs / Examinatrices : Françoise Daverat, Laurent Chauvaud, Matthias Vignon, Bruno Ernande, Élise Dufour
Rapporteurs / Rapporteuses : Mireille Harmelin-Vivien, Françoise Daverat

Résumé

FR  |  
EN

L’évaluation et la gestion des populations de poissons se basent sur l'utilisation d’unités de gestion appelées « stocks halieutiques ». Pour discriminer ces stocks, la forme des otolithes, pièces calcifiées de l’oreille interne des poissons, peut être utilisée. Dans ce contexte, cette thèse s'est consacrée premièrement à l’étude de la variabilité spatio-temporelle de la forme des otolithes chez 3 espèces de poissons présentant des caractéristiques écologiques (taille, vitesse de nage, comportement dans la colonne d’eau, etc.) et des environnements biogéographiques différents. Les résultats montrent qu’il existe un gradient structurel décroissant de taille des stocks allant des espèces de grands pélagiques aux espèces démersales. Ceci est lié au fait que certaines espèces démersales comme la bogue (Boops boops) sont contraintes par la présence de barrières géographiques et de fronts hydrologiques ce qui n’est pas le cas chez les espèces pélagiques analysées (merlan bleu, Micromesistius poutassou ; Espadon, Xiphias gladius). Dans un deuxième temps, nous avons testé les effets de facteurs confondants potentiels (e.g. l’asymétrie bilatérale directionnelle, AD) sur le pouvoir discriminant de la forme des otolithes. Ainsi, nous avons montré qu'il existe chez la bogue une AD, induite par un processus de latéralisation et qui varie en amplitude et en direction selon la zone géographique étudiée. Chez la bogue, cette AD impacte les résultats d’identification des stocks par la forme qui changent en fonction de l'otolithe, droit ou gauche, utilisé. Si la forme de l’otolithe est utilisée pour discriminer les stocks halieutiques, c’est parce qu’elle reflète en particulier les conditions environnementales qu’a subi le poisson au cours de sa vie. Ainsi, dans la troisième partie de la thèse, nous avons analysé, en conditions contrôlées, les effets de la température et du taux d'acides gras polyinsaturés omega-3 (n-3 AGPI) contenus dans l’alimentation sur la morphogenèse des otolithes de bars (Dicentrachus labrax). Après la naissance, deux étapes peuvent être distinguées dans l’ontogenèse de la forme de l’otolithe avec en premier lieu un allongement qui traduit une croissance moins rapide de l’axe dorso-ventral par rapport à l’axe antéro-postérieur. Il s'en suit des modifications plus localisées avec en particulier une complexification de la zone comprise entre le rostre et l’anti-rostre a priori essentiellement liée au facteur thermique. A l’inverse, le taux de n-3 AGPI ne semble pas influencer la morphogenèse de l’otolithe. L’utilisation des degrés-jours de croissance (GDD) a permis de montrer que l’effet de la température est bien d’accélérer la morphogenèse, mais aussi de changer sa trajectoire: à valeur de GDD fixe, pour 2 températures données, les formes diffèrent. L’ensemble des résultats acquis lors de cette thèse valident l’utilisation de la forme des otolithes pour discriminer les stocks de poissons, mais souligne également le besoin de connaître précisément les sources de la variabilité morphologique des otolithes intra-stock pour pouvoir déterminer plus précisément les limites des stocks halieutiques.