La modélisation tridimensionnelle est devenue plus accessible et plus rapide en orthopédie et en particulier en chirurgie de l’épaule. L’analyse morphométrique qui en est issue est utilisée pour permettre une meilleure compréhension de l’omarthrose. L’objectif global de cette thèse était de valider l’application d’un logiciel de segmentation automatisée tridimensionnelle dans les étapes de prise en charge du patient. Huit études ont permis de valider les mesures automatiques calculées par le logiciel, d’améliorer la classification des omarthroses primaires puis de décrire la géométrie 3D normale et pathologique de l’épaule. Des seuils numériques précis ont pu être établis entre les différents types. Le logiciel a permis de développer et valider l’utilisation d’un angle (RSA-angle) permettant de mieux positionner l’implant glénoïdien dans les prothèses inversées d’épaule. L’utilisation des mobilités simulées en 3D démontrait l’intérêt du logiciel dans la compréhension des conflits osseux après prothèse et des faiblesses de design d’implant. Enfin, le positionnement de l’implant glénoïdien en peropératoire avec un guide patient-spécifique imprimé en 3D correspondait fidèlement à sa planification préopératoire, cependant, la planification à elle seule améliorait déjà considérablement ce positionnement. Ce travail de thèse a permis de valider les performances et l’utilisation d’un logiciel de segmentation tridimensionnel et de planification préopératoire. Son application se retrouve dans plusieurs étapes de la prise en charge d’un patient atteint d’omarthrose et devrait progressivement s’intégrer dans la pratique quotidienne des chirurgiens.