Thèse soutenue

Rôle de la connectivité et de l'adaptation locale dans la structure et le fonctionnement des populations de coquilles Saint-Jacques (Pecten maximus) en Manche, Mer d'Iroise et Rade de Brest
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Auteur / Autrice : William Handal
Direction : Pierre Boudry
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie marine
Date : Soutenance le 22/11/2019
Etablissement(s) : Brest
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la mer et du littoral (Plouzané)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire des sciences de l’environnement marin (Plouzané, Finistère)
Jury : Président / Présidente : Vianney Pichereau
Examinateurs / Examinatrices : Pierre Boudry, Vianney Pichereau, Frédérique Viard, Sylvie Lapègue, Grégory Charrier, François Bonhomme
Rapporteurs / Rapporteuses : Frédérique Viard, Sylvie Lapègue

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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L'objectif principal de cette thèse était d’améliorer notre compréhension de la connectivité et de l'adaptation locale entre les principaux gisements de coquille Saint-Jacques à l'échelle de la Bretagne et de la Manche. Ce travail s'est structuré autour de trois axes, (i) Une étude basée sur l'association entre données microsatellites et modèle démogénétique a été réalisée afin d’explorer la structure génétique neutre des principaux gisements de coquilles Saint-Jacques sur l’ensemble de la Manche. Il ressort de cette étude une différenciaton génétique entre les gisements localisés à l'Ouest de Start Point de ceux du reste de la Manche, suggérant l'existence d’une entité indépendante reproductivement. (ii) La structure génétique neutre entre la Manche Ouest, la Mer d'Iroise et la Rade de Brest a été analysée, à l'aide d’approches de ‘Genotyping by Sequencing' (GBS) et d’un modèle hydrodynamique, afin d'étudier le degré de connectivité de la population de Rade de Brest vis-à-vis des populations environnantes, dans un contexte d'ensemencement massif du gisement de Brest par du naissain issu d'écloserie. Les résultats suggèrent (1) le rôle prépondérant du Front de Ouessant comme barrière à la dispersion larvaire entre la Manche Ouest et la Mer d'Iroise et la Rade de Brest et (2) des flux larvaires de la Baie de la Baie de Douarnenez alimentant la Rade de Brest associés à une absence de structure génétique entre ces régions. (iii) Enfin, la structure adaptative des gisements distribués entre la Rade de Brest, la Baie de Morlaix et le Golfe Normano-Breton a été explorée à l'aide des GBS. Pour la première fois sont observés à fines échelles des processus adaptatifs entre les gisements de Rade de Brest et du Golfe Normano-Breton. Ce corpus de résultats révèle l'existence d'isolement démographique et génétique entre les gisements die P. maximus de Manche, Mer d'Iroise et Rade de Brest et suggère pour la première fois des signaux de sélections à fines échelles entre gisements fortement ensemencés. Cette thèse ambitionne de contribuer à la prise de décision en matière de gestion des stocks de coquille Saint-Jacques en Manche et Bretagne.