Atrésie chez le chinchard Trachurus Murphyi Nichols, 1920 : implications dans la dynamique de la reproduction

Atresia in the Chilean Jack Mackerel Trachurus murphyi Nichols, 1920 : implication for reproductive dynamics

• Auteur / Autrice : Paola Alejandra Gonzalez Kother
• Direction : Dario Moraga, Marcelo Oliva
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie marine
• Date : Soutenance le 10/10/2019
• Etablissement(s) : Brest en cotutelle avec Universidad de Antofagasta (Chili)
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la mer et du littoral (Plouzané)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire des sciences de l’environnement marin (Plouzané, Finistère)
• Partenaire(s) de recherche : Etablissement d'accueil : Universidad de Antofagasta (Chili)
• Jury : Président / Présidente : Maria Teresa González
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Dario Moraga, Marcelo Oliva, Maria Teresa González, Jean-Yves Toullec, Luis Cubillos, Arnaud Tanguy
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Jean-Yves Toullec, Luis Cubillos

Mots clés

Mots clés contrôlés

Malformations

Reproduction (biologie)

Trachurus murphyi

Mots clés libres

Atrésie

Transcriptomique

Trachurus murphyi

Atresia

Transcriptomic

Trachurus murphyi

Résumé

Le chinchard, Trachurus murphyi constitue une espèce importante pour la pêcherie dans le sud-est de l'océan Pacifique. Dans cette thèse, la morphologie des ovocytes atrétiques, prévalence et l'intensité de l'atrésie ont été décrits. Les stades d'atrésie identifiés sont les stades alpha, bêta et gamma. Les modèles linéaires généraux ont montré que l’incidence des follicules pot-ovulatoires, la température de surface de la mer et le facteur mois/année, expliquent la prévalence et l'intensité. La dynamique des stades alpha et bêta-atrésie pourrait être considérée comme un indicateur potentiel de toute perturbation de la saison de frai de cette espèce. Cette étude constitue une première évaluation comparative de la fécondité entre les femelles atrétiques et non atrétiques pour cette espèce.La fécondité partielle et la fécondité relative sont inférieures à celles observées chez d’autres espèces de Trachurus. T. murphyi, la base de données transcriptomique (tissus du foie et des ovaires) a été générée. Cette étude a notamment permis d’identifier quelques marqueurs plus spécifiques de l'atrésie comme des protéines de liaison aux acides gras (FABP) et de la follistatine. L'analyse transcriptomique a démontré l'expression de gènes potentiellement associés à une infection par des protozoaires.L’ensemble du foie de T. murphyi est parasité par Goussia cruciata (Apicomplexa).L'abondance du parasite était corrélée négativement à la longueur totale de l'hôte. Une relation potentielle entre l’infection par les protozoaires et l’atrésie ne peut être établie.

The Chilean jack mackerel Trachurus murphyi support an important fishery in the South-eastern Pacific Ocean which has declined considerably over time. In this thesis, morphology of atretic oocytes in T. murphyi as well, patterns of prevalence and intensity of atresia were described. The stages of atresia identified were alpha, beta and gamma. General linear models showed that incidence of postovulatory follicles, sea surface temperature and month/year, explain the prevalence and intensity of atresia. Dynamics of alpha and beta-atresia could be considered a potential proxy for any disruption of spawning season and the end of spawning season. This is the first assessment comparing fecundity between atretic and not atretic females.The batch fecundity and relative fecundity were lowest compared with other species of Trachurus. In T. murphyi, the transcriptomic database (liver and ovary tissue) was generated. The results show a set of core potential genes as markers for atresia as fatty acid-binding protein (FABP) genes and follistatin. The transcriptomic analysis demonstrated the expression of genes associated to protozoan infection. All liver of T. murphyi were parasitized by Goussia cruciate (Apicomplexa), the abundance of the parasite was negative correlated with the host total length. A potential relationship between protozoan infection and atresia cannot be established.