Les inventaires taxonomiques de la biodiversité des invertébrés macroscopiques marins : des outils pour la connaissance et la gestion de la protection de la biodiversité marine (exemples en Martinique)

Taxonomic inventories of the biodiversity of marine macroscopic invertebrates : tools for knowledge and management (Example in Martinique)

• Auteur / Autrice : Romain Ferry
• Direction : Juliette Emilie Smith-Ravin
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Physiologie et biologie des organismes - populations - interactions
• Date : Soutenance le 12/12/2019
• Etablissement(s) : Antilles
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Milieu insulaire tropical à risques : protection, valorisation , santé et développement (Pointe-à-Pitre)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Archéologie Industrielle- Histoire- Patrimoine- Géographie- Développement- Environnement de la Caraïbe [EA 929] / AIHP-GEODE
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Juliette Emilie Smith-Ravin, Mehdi Adjeroud, Pascal Saffache, René Galzin, Joseph Poupin, Fabienne Priam
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Mehdi Adjeroud

Mots clés

Mots clés contrôlés

Martinique (France)

Invertébrés marins

Mots clés libres

Invertébrés marins

Marine invertebrates

Résumé

Les travaux menés dans cette thèse explorent les différents apports possibles des inventaires taxonomiques d’invertébrés macroscopiques marins, qu’ils s’intéressent à un groupe taxonomique particulier ou à la biodiversité d’espèces dans un habitat, afin d’apporter de la connaissance mais aussi pour répondre à des problématiques de gestion telles que : Quelle espèce protéger ? Quel habitat protéger ? Quelle espèce exotique envahissante éradiquer ?Le premier axe de ces travaux s’intéresse à l’inventaire d’espèces par groupe taxonomique et à l’inventaire multitaxon pour une zone afin d’en évaluer la biodiversité. Dans une première partie, deux des inventaires taxonomiques sont centrés sur des groupes taxonomiques, ils sont réalisés en collaboration avec des spécialistes, ils concernent : l’inventaire taxonomique des hydraires et celui des gorgones. La seconde partie utilise des inventaires simplifiés, s’intéressant à la majorité des taxons, mais centré sur des zones spécifiques afin d’en évaluer la biodiversité : Une étude concerne les parties marines qui sont à proximité des mangroves, et la seconde étude à la caye Grande Sèche au cœur la baie de Fort-de-France. Dans une troisième partie, les inventaires de la biodiversité d’espèces sont mis à profit pour mettre à jour la typologie des habitats marins benthiques, à partir de données collectées lors de l’expédition Madibenthos (MNHN) et notamment de photographies prises par les participants. Et enfin, dans une dernière partie les inventaires multitaxons réalisés à l’échelle de la Martinique sont mis à profit pour évaluer quelles sont les espèces d’invertébrés rares en Martinique qui peuvent être candidate à une protection ou au statut d’espèce déterminante pour l’établissement de ZNIEFF.Le second axe de ces travaux s’intéresse à l’inventaire d’espèces protégées d’invertébrés macroscopiques, notamment les coraux, dont l’état des populations est préoccupant, ceci en vue de cartographier leur répartition et d’évaluer des sources des pressions et menaces constatées. Dans un premier temps, il est indiqué la mise au point d’une méthode qui a permis de cartographier une espèce de corail protégée de petite taille, Oculina diffusa. L’étude montre que l’habitat de cette espèce est très spécifique et qu’elle subit de nombreuses pressions. Dans un second temps, une méthode utilisant différentes techniques de télédétection et d’inventaire in situ a été mise au point pour cartographier la répartition d’espèces de coraux de grande taille (Orbicella favelolata, O. annularis, O. franksii) sur une caye. Enfin, dans un troisième temps, les résultats d’inventaires multitaxon ont permis de caractériser la rareté ou la faible abondance de certaines espèces de coraux en Martinique, résultats qui ont œuvré pour la protection des coraux.Le troisième axe s’intéresse à l’inventaire des espèces non-indigènes et d’espèces exotiques envahissantes d’invertébrés macroscopiques en vue de cartographier leur répartition et d’évaluer leurs impacts sur les espèces autochtones et leurs habitats. L’étude présente trois espèces non indigènes dont le statut est attesté pour certaines en tant qu’espèce exotique envahissante ou est en cours d’évaluation pour d’autre. La première espèce présentée, étudiée en 2015, est un crabe invasif Charybdis hellerii. L’étude de cette espèce a permis de signaler sa présence pour la première fois dans les Petites Antilles. L’étude biométrique des populations et du sex-ratio, a permis de caractériser la population. Une étude de l’habitat occupé permet de mieux étudier son impact et mieux cibler les habitats à surveiller. La seconde espèce est une d’ophiure non-indigène, Ophiothela mirabilis, étudiée en 2017 sur la côte atlantique de la Martinique.

The work carried out in this thesis explores the various possible contributions of taxonomic inventories of marine macroscopic invertebrates, whether they are interested in a particular taxonomic group or the biodiversity of species in a habitat, in order to bring knowledge but also to respond to management problems such as: What species to protect? What habitat to protect? Which invasive alien species to eradicate?The first aspect of this work is the inventory of species by taxonomic group and the multitaxon inventory for an area, in order to assess its biodiversity. In the first part, two of the taxonomic inventories are centered on taxonomic groups, they are carried out in collaboration with specialists and concern the taxonomic inventory of hydraries and that of gorgonians. The second part uses simplified inventories, focusing on the majority of taxa, but focused on specific areas in order to assess their biodiversity: A study concerns the marine parts that are close to the mangroves, and the second study at the caye “Grande Sèche” in the heart of the bay of Fort-de-France. In a third part, species biodiversity inventories are used to update the typology of benthic marine habitats, using data collected during the Madibenthos Expedition (MNHN) and in photographs taken by the participants. And in the final part, the multitaxons inventories carried out throughout Martinique are used to evaluate which species of invertebrates are rare in Martinique and that can be candidates for protection or species status determining the establishment of ZNIEFF.The second aspect of this work is the inventory of protected species of macroscopic invertebrates, including corals, whose population status is of concern, in order to map their distribution and assess sources of pressures and threats. First, it is indicated the development of a method that allowed to map a small protected coral species, Oculina diffusa. The study shows that the habitat of this species is very specific and that it is under many pressures. Second, a method using different remote sensing and in situ inventory techniques was developed to map the distribution of large coral species (Orbicella favelolata, O. annularis, O. franksii) on a caye. Finally, in a third phase, the results of multitaxon inventories have helped to characterize the rarity or low abundance of certain coral species in Martinique, results that have worked towards the protection of corals..The third axis focuses on the inventory of non-native species and invasive alien species of macroscopic invertebrates to map their distribution and assess their impacts on native species and their habitats. The study presents three non-native species, some of which are certified as invasive alien species or are being evaluated for others. The first species presented, studied in 2015, is an invasive crab Charybdis hellerii. The study of this species made it possible to report its presence for the first time in the Lesser Antilles. The biometric study of populations and sex ratios has helped to characterize the population. A study of occupied habitat allows for a better study of its impact and better targeting of the habitats to be monitored. The second species is a non-native ophiure, Ophiothela mirabilis, studied in 2017 on the Atlantic coast of Martinique. Finally the third species studied is a non-native coral, Tubastraea coccinea, its population has increased in recent years, a first mapping is proposed. This study was conducted at the very beginning of the expansion of the non-native species, it specifies the number of species of host gorgonians and the maximum colonization density reached in some gorgonians. The results obtained during these inventories have provided a more accurate view of the state of marine biodiversity, they have contributed to the protection of species and areas. They should contribute to better management and protection of the marine environment in Martinique.