La présente thèse traite de la pauvreté, du paludisme et des réformes des systèmes de santé en Afrique. Elle est motivée par la persistance des inégalités sociales, la prévalence et la mortalité liées au paludisme toujours élevées en Afrique subsaharienne dans un contexte pourtant marqué par une large utilisation des Moustiquaires Imprégnées d’Insecticides (MII) et la mise en œuvre des réformes innovantes dans les systèmes de santé. Nous nous sommes appuyés sur trois études appliquées au Cameroun. Ce pays expérimente depuis 2012 l’approche du Financement Basé sur la Performance (FBP) dans son système de santé. Nous avons recouru avons recouru aux données des enquêtes d’évaluation d’impact du FBP réalisées dans ce pays en 2012 et en 2015. Nos résultats montrent dans un premier temps que le faible niveau de vie des ménages prédispose ses membres de moins de 5 ans au paludisme. Dans un deuxième temps, nous trouvons que les chocs de paludisme très fréquents chez les enfants de moins de 5 ans affectent négativement l’offre de travail de leur mère. Dans un troisième temps, nous trouvons que les réformes apportées par le FBP impactent significativement et de manière positive l’utilisation des services de santé modernes en cas de paludisme chez les enfants de 0-59 mois, surtout chez les pauvres et en milieu rural.Les résultats ainsi obtenus pourraient orienter les pays endémiques d’Afrique subsaharienne, dans la mise en œuvre de la nouvelle feuille de route pour l’atteinte des objectifs de développement durable, à formuler des politiques conséquentes de lutte contre le paludisme et contre la pauvreté.