Détection précoce d'une maladie fongique « la tavelure du pommier » par imagerie hyperspectrale

Early detection of a fungal disease « apple scab» by hyperspectral imaging

• Auteur / Autrice : Maroua Nouri
• Direction : Jean-Michel Roger
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Génie des procédés
• Date : Soutenance le 25/06/2018
• Etablissement(s) : Montpellier, SupAgro
• Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale GAIA Biodiversité, agriculture, alimentation, environnement, terre, eau (Montpellier ; 2015-...)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : ITAP Information et Technologie pour les Agro-Procédés INRAE SupAgro Montpellier
• Jury : Président / Présidente : Christian Germain
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Jean-Michel Roger, Christian Germain, Christelle Gée, Jawad Aarrouf
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Christelle Gée, Jawad Aarrouf

Mots clés

Mots clés libres

Imagerie hyperspectrale

Tavelure

Détection précoce

Pls-Da

Spectre

Hyperspectral imaging

Apple scab

Early detection

Pls-Da

Spectra

Résumé

La tavelure du pommier et les anthracnoses du noyer sont les maladies majeures pour ces deux espèces. Les stratégies de lutte contre la tavelure sont basées sur des modèles climatiques. Les applications sont soit préventives avec un nombre élevé de traitements, pour couvrir tous les évènements contaminants et doivent être renouvelées en cas de lessivage ou de pousses croissantes, soit curatives pour rattraper un défaut de protection. La connaissance précoce de la réalité de l’infection permettrait de positionner les traitements sur des éléments contaminants réels. Sur noyer, la meilleure connaissance des mécanismes d’infection est essentielle pour développer à terme des méthodes de lutte ciblées contre ces agents pathogènes, les traitements précoces étant les plus efficaces. L’imagerie hyperspectrale peut permettre de déterminer le moment de la contamination par le suivi in situ du développement des champignons et ainsi adapter et optimiser le programme de traitement.

Apple scab and anthracnose of walnut are the major diseases for the both species. Fight strategies against scab apple are based on climate models. Preventive applications uses always a high number of treatments, to cover all contaminants events. Curative applications are used to catch a protection fault. Early knowledge of the reality of the infection would help to choose the best treatments of the real contaminants. On Walnut, the best knowledge of the infection mechanism is essential to develop a targeted control methods against these pathogens. Hyperspectral imaging can help to determine the real time of contamination by monitoring in situ the growth of fungi and thus adjust and optimize the treatment program.