Phylogénie et évolution des pigeons et tourterelles (Columbidae) à différentes échelles de temps et d’espace

Phylogeny and evolution of pigeons and doves (Columbidae) at different space and time scales

• Auteur / Autrice : Jade Bruxaux
• Direction : Christophe Thébaud, Guillaume Besnard
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Ecologie biodiversite evolution
• Date : Soutenance le 08/03/2018
• Etablissement(s) : Toulouse, INSA
• Ecole(s) doctorale(s) : ECOLE DOCTORALE SCIENCES ECOLOGIQUES, VETERINAIRES, AGRONOMIQUES ET BIOINGENIERIES
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire Evolution et Diversité Biologique - Laboratoire Evolution et Diversité Biologique (EDB UMR 5174)- Université de Toulouse- CNRS- ENFA- UPS
• Jury : Président / Présidente : Pierre-André Crochet
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Christophe Thébaud, Guillaume Besnard, Emmanuel Douzery, Marianne Elias, Alice Cibois, Céline Brochier-Armanet
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Emmanuel Douzery, Marianne Elias

Mots clés

Mots clés contrôlés

Columbidés

Phylogénie

Génomique

Biogéographie

Évolution

Mots clés libres

Evolution

Biogéographie

Génomique

Phylogénie

Columbidae

Evolution

Biogeography

Genomics

Phylogeny

Columbidae

Résumé

Les pigeons et tourterelles (Columbidae) appartiennent à une famille riche en espèces et mondialement distribuée, d’importance majeur sur le plan historique et écologique. Nous avons généré des hypothèses phylogénétiques à partir d’échantillons de musées pour clarifier le processus de diversification de la famille, qui s’est probablement déroulé entre le milieu de l’Eocène et du Miocène. Près de 60% des espèces de columbidés sont présentes sur des îles, et ces entités ont probablement joué un rôle dans la dispersion entre continents. A l’inverse, les taux de spéciation varient selon une distribution normale et l’insularité ne semble pas avoir joué un rôle important dans la diversification. Malgré tout, la diversité maximale est atteinte en Asie du Sud-Est et en Australasie, régions particulièrement riches en îles. La Nouvelle-Guinée, en particulier, héberge une diversité impressionnante. Les columbidés les plus gros, appartenant au genre Goura (pigeons couronnés), sont endémiques de cette île. Nos analyses suggèrent que leur diversification a probablement démarré au sein de la Nouvelle-Guinée il y a environ 5.73 millions d’années. Des événements géologiques tels que l’orogénèse de la cordillère centrale ont probablement joué un rôle important en partageant la distribution de l’aire ancestrale. Des dispersions par-delà des barrières géographiques établies peuvent ensuite avoir permis l’établissement de populations isolées et entrainé leur diversification.

Pigeons and doves (Columbidae) belong to a species-rich worldwide-distributed family and are of major historical and ecological importance. We generated phylogenetic hypotheses from museum samples to clarify the diversification of the family, which probably took place between mid-Eocene and mid-Miocene, where all extant clades were already established. Almost 60% of species are present on islands, and these entities probably played a role in the dispersal through stepping-stones movement between continents. On the other side, speciation rates vary following a normal distribution and islands do not seem to have played an important role in diversification. Nevertheless, the highest Columbidae species-richness is reached in South-East Asia and Australasia, regions especially rich in islands. New Guinea, in particular, hosts an impressive diversity. The biggest Columbidae, belonging to the genus Goura (crowned pigeons), are endemic to this island. Our analyses suggest that their diversification probably started within New Guinea around 5.73 Ma. Geological events such as the cordillera orogeny probably played a major role by splitting ancestral distribution, while more recent dispersals over barriers may have also led to the settlement of isolated populations that promoted diversification. This work allowed the generation of phylogenetic hypotheses, which will allow answering numerous questions regarding Columbidae biogeography and diversification.