Développement d'outils moléculaires standardisés pour les espèces levuriformes du clade CTG

Development of a standardized toolkit for CTG clade yeast

• Auteur / Autrice : Tatiana Defosse
• Direction : Nathalie Guivarc'h, Nicolas Papon
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences de la vie et de la santé, spécialité Biotechnologie
• Date : Soutenance le 12/12/2017
• Etablissement(s) : Tours
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Centre-Val de Loire ; 2012-....)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Biomolécules et biotechnologies végétales (Tours)
• Jury : Président / Présidente : Antoine Touzé
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Alix Coste
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Thomas Guillemette, Jérôme Govin

Mots clés

Mots clés contrôlés

Fluorescence

Mycologie médicale

Recherche

Biologie de synthèse

Génie génétique

Levures (botanique)

Acide mycophénolique

Microorganismes d'intérêt industriel

Microorganismes -- Biotechnologie

Biomédicaments

Transgénose

Expression génique

Mots clés libres

Levure

Clade CTG

Transgénèse

Outils moléculaires

Biotechnologie

Yeast

CTG clade

Transgenese

Molecular tools

Biotechnology

Résumé

Parmi les espèces de levures du clade CTG, certaines sont responsables de candidoses tandis que d’autres présentent des potentiels en biotechnologie. Depuis quelques années, nous assistons à une intensification des recherches sur ces levures. Cependant, leur code génétique particulier a ralenti la mise au point d’outils génétiques pour la plupart d’entre elles. Cette thèse vise à développer des outils moléculaires standardisés pour un grand nombre d’espèces de levures du clade CTG. Nous avons d’abord conçu des vecteurs d’expression adaptés à l’espèce M. guilliermondii. Par la suite, nous avons caractérisé le gène de résistance à l’acide mycophénolique IMH3.2 afin de l’utiliser comme marqueur de sélection lors de la transgénèse d’espèces du clade CTG. Enfin, nous avons mis au point une série de vecteurs permettant la manipulation génétique de ces espèces. Ce travail a conduit à la conception d’une large gamme d’outils utilisable dans un grand nombre de ces levures, pré-requis essentiel aux futurs recherches en mycologie médicale et au développement de stratégies de biologie synthétique.

The fungal CTG clade includes well-known yeasts of clinical importance and/or biotechnological potential. Thus, albeit being intensively studied over the last 30 years, their uncommon genetic code precludes the use of the widely available markers and reporter systems for genetic approaches in these microorganisms. We provide here a toolbox to genetically manipulate a wide range of CTG clade species. Firstly, we developed a new series of versatile controllable expression vectors for M. guilliermondii. After, we characterized MPA-resistant gene IMH3.2 et used it as a drug resistance marker in several yeast species. Finaly, we provide a molecular toolbox suitable to genetically manipulate a broad range of prominent species from the CTG clade. This versatile toolkit represents a new starting point for successful developments of research in medical mycology in the CTG clade but also will expedite synthetic biology strategies in these microorganisms for biotechnological applications.