Structures et fonctions du domaine C-Terminal de l'intégrase du VIH-1

Structures and functions of the C-Terminal domain of HIV-1 integration

• Auteur / Autrice : Oyindamola Oladosu
• Direction : Marc Ruff
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biophysique et biologie structurale
• Date : Soutenance le 16/05/2017
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale des Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
• Jury : Président / Présidente : Matteo Negroni
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Serena Bernacchi, Vincent Parissi
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Marie-Line Andréola, Serge Bouaziz

Mots clés

Mots clés contrôlés

Dissertations universitaires

Multimérisation de protéines

Protéines virales

Intégrase du VIH

Mots clés libres

Integrase du VIH

Domaine C-terminal

Chromatine

Coévolution

Multimerisation

HIV Integrase

C-terminal domain

Chromatin

Coevolution

Multimerization

Résumé

L’Integrase du VIH est une ADN recombinase catalysant deux réactions qui permettent l'intégration de l'ADN viral dans l'ADN hôte. L’intégrase du VIH comprend 3 domaines : N-terminal impliqué dans la réaction de « 3' processing » et le transfert de brin, le domaine catalytique contenant le site actif et le domaine C-terminal liant l'ADN non-spécifiquement (CTD). Des recherches récentes mettent en évidence l'importance du CTD dans la liaison avec d'autres protéines virales comme la transcriptase inverse. Le but de la thèse était de comprendre les rôles et l'importance du domaine C-terminal de l’intégrase dans deux contextes : l'intégration dans la chromatine et la coévolution, avec l'objectif de comprendre le rôle de la multimerisation dans la fonction de l’intégrase. Globalement, les résultats de mon projet indiquent que l'IN-CTD joue un rôle important, en contribuant à la formation de multimères d'ordre supérieur importants pour la fonction de l’IN.

HIV Integrase is a DNA recombinase that catalyzes two endonucleolytic reactions that allow the viral DNA integration into host DNA for replication and subsequent viral protein production. HIV Integrase consists of 3 structural and functional domains: The N-terminal zinc domain involved in 3’ processing and strand transfer, the catalytic core domain which contains the active site, and the C-terminal domain that binds DNA non- specifically. Recent research highlights the importance of the CTD in binding with other viral proteins such as Reverse Transcriptase. The aim of the thesis was to understand the roles and importance of the C-terminal domain of HIV-1 Integrase in two contexts: chromatin integration, and co-evolution, with the overall purpose of understanding the role of multimerization in IN function. Overall, results from my project indicate that the IN-CTD plays an important role, by contributing to the formation of higher order multimers that are important for IN functionality.