Détermination des mécanismes physiopathologiques d'anomalies rares de la coagulation à l'aide de modèles in vitro et d'approches génétiques innovantes

Physiopathological mechanism determination of rare coagulation abnormalities using in vitro experiments and innovative genetic approaches

• Auteur / Autrice : Yohann Jourdy
• Direction : Gamze Yesim Buzluca Dargaud, Christine Trouillot-Vinciguerra
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie médicale
• Date : Soutenance le 20/12/2017
• Etablissement(s) : Lyon
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Interdisciplinaire Sciences-Santé (Villeurbanne ; 1995-....)
• Partenaire(s) de recherche : établissement opérateur d'inscription : Université Claude Bernard (Lyon ; 1971-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Hémostase, Inflammation et Sepsis
• Jury : Président / Présidente : Claude Négrier
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Cédric Hermans
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Pierre Morange, Philippe Nguyen

Mots clés

Mots clés contrôlés

Épissage (génétique)

Thrombomoduline

Hémophilie

Mots clés libres

Hémophilie

Thrombomodulin

Mutation d'épissage

Séquence Alu

Haemophilia

Thrombomodulin

Alu element

Splicing mutation

Résumé

Les déficits en facteurs de la coagulation sont des pathologies hémorragiques congénitales rares. Le développement récent des techniques de biologie moléculaire ont permis l'indentification de nombreuses anomalies génétiques dans les gènes codant les facteurs de coagulation. Cependant, la détermination de l'impact clinique réel de ces nouveaux variants est souvent un défi pour le biologiste moléculaire.La première partie de ce travail a consisté à l'étude par analyse chromosomique sur puce à ADN de grands réarrangements génomiques identifiés chez des patients hémophiles A ou B ayant parfois des phénotypes cliniques atypiques. Nous avons montré que certains gènes voisins des gènes F8 et F9 étaient associés, lorsqu'ils sont concernés par ces réarrangements de grande taille, à des déficits mentaux (SOX3) ou des pathologies cardiovasculaires (BRCC3).La seconde partie de cette étude a été centrée sur l'étude des variants de signification indéterminée localisés au niveau des sites d'épissage. Nous avons démontré par l'utilisation conjointe d'algorithmes informatiques et de tests in vitro de type minigène la pathogénicité de 21 variants identifiés chez des hémophiles A.La dernière partie de ce travail a consisté en la description de nouveaux mécanismes moléculaires responsables de pathologies hémorragiques. Nous avons identifié une délétion intronique chez 6,1% des hémophiles A mineurs de notre cohorte. Nous avons montré que cette anomalie était probablement responsable d'une dérégulation de l'hnRNP C ce qui entrainait l'insertion d'une séquence AluY dans les transcrits du gène F8. Enfin, nous avons décrit les mécanismes moléculaires responsables de la présence de concentrations très élevées de thrombomoduline soluble dans les plasmas de patients porteur de la mutation du gène THBD c.1611C>A. Ces travaux ont permis de détecter et de mieux appréhender certains mécanismes moléculaires responsables de pathologies rares hémorragiques

Inherited coagulation disorders are caused by a large number of genetic abnormalities. However, the determination of the clinical impact for some of these genetic variations is challenging for the molecular biologist.In a first part, we characterized large genomic rearrangements in haemophilia patients using cytogentic microarray analysis. In a first study, we delineated six F9 complete deletions in order to investigate genotype/phenotype correlations. We identified SOX3 as a candidate gene for intellectual disability (ID) found Haemophilia B patients. In a second study, we described five complex Xq28 rearrangements in Haemophilia A (HA) patients. We showed that several F8 neighbouring genes are involved in these rearrangements and some of these genes are involved in other pathologies such as ID, physical abnormalities and cardiovascular disease. Such investigations would be particularly useful for genetic counseling in female carriers to assess the risk of transmitting haemophilia associated with other diseases.In a second, we developed a minigene assay to characterise putative splice site mutations in F8 and we showed that 21 out of the 26 variations studied are associated with splicing defect.In the third part, we described two original molecular mechanisms leading to coagulation disorders. In a first case, we reported a recurrent deep intronic deletion in mild HA. We gave some evidences that this deletion promoted AluY exonization in F8 transcrits. Due to its high prevalence (6.1%), this deletion must be investigated in all patients with mild HA in whom no mutation has been detected by standard genetic analysis. In the second study we investigated the mechanism responsible for bleeding tendency in patient carrying the THBD c.1611C>A and having high levels of soluble thrombomoduline (TM). We showed that a higher sensitivity of the mutated TM to the proteolysis by metalloproteases and a defect of TM synthesis seemed responsible for TM shedding