Études moléculaires et structurales - d’un nouveau mode de dimérisation des intégrases rétrovirales pour développer des modulateurs d’oligomérisation ET - de l’intégrase porcine de PERV-A/C en complexe avec son cofacteur cellulaire humain Brd2 dans un contexte de xénotransplantatio
Auteur / Autrice : | Halima Yajjou |
Direction : | Patrice Gouet, Corinne Ronfort |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Biochimie |
Date : | Soutenance le 08/03/2017 |
Etablissement(s) : | Lyon |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale Interdisciplinaire Sciences-Santé (Villeurbanne ; 1995-....) |
Partenaire(s) de recherche : | établissement opérateur d'inscription : Université Claude Bernard (Lyon ; 1971-....) |
Laboratoire : Institut de biologie et chimie des protéines (Lyon ; 2016-....) | |
Jury : | Président / Présidente : Adriana-Erica Miele |
Examinateurs / Examinatrices : Marc Ruff | |
Rapporteurs / Rapporteuses : Solange Morera, Vincent Parissi, Marc Ruff |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Mots clés libres
Résumé
L'intégrase (IN) est une enzyme essentielle du cycle réplicatif des rétrovirus, qui catalyse l'intégration de l'ADN viral rétrotranscrit dans le génome de la cellule cible. Des données structurales, précédemment obtenues par notre équipe, ont conduit à la conception rationnelle de molécules susceptibles de bloquer l'IN sous une forme oligomérique inactive. Des tests d'intégration concertée in vitro ont permis d'étudier leur effet sur l'activité enzymatique de l'IN.Le porc est porteur d'un Gammaretrovirus endogène appelé Porcine Endogenous RetroVirus (PERV), susceptible d'être transmis à l'homme lors d'une xénotransplantation. L'étude structurale de l'IN du virus recombinant PERV-A/C a pour but de mieux comprendre son fonctionnement et de guider le développement rationnel d'inhibiteurs limitant le risque de xénozoonose. J'ai modélisé l'intasome de l'IN de PERV-A/C en complexe avec le raltégravir, un médicament utilisé comme traitement anti-VIH. J'ai ensuite mis au point des protocoles de purification permettant d'étudier le domaine carboxy-terminal (Carboxy Terminal Domain ou CTD) de l'IN de PERV-A/C isolé et en complexe avec le CTD du cofacteur cellulaire humain Brd2. L'enveloppe SAXS de ce complexe a été déterminée. En parallèle, une étude par histone array, réalisée avec le CTD seul de l'IN de PERV-A/C, a révélé un profil de spécificité pour des queues d'histones H2B et H3 portant des modifications post-traductionnelles