Déterminisme du support moléculaire et de l'épidémiologie de la résistance aux β-lactamines chez des bacilles à Gram négatif isolés dans des hôpitaux tunisiens et libyens

Determinism of molecular support and epidemiology of resistance to b-lactamines in clinical isolates of gram-negative bacilli in tunisian and libyan hospitals

• Auteur / Autrice : Najla Mathlouthi
• Direction : Jean-Marc Rolain, Chedly Chouchani
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Pathologie humaine. Maladies infectieuses
• Date : Soutenance le 08/04/2017
• Etablissement(s) : Aix-Marseille en cotutelle avec Université de Tunis El-Manar. Faculté des Sciences de Tunis (Tunisie)
• Ecole(s) doctorale(s) : École Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Unité des rickettsies (Marseille)
• Jury : Président / Présidente : Imène Ouzari Cherif
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Imène Ouzari Cherif, Taoufik Ghrairi, Marie Kempf, Philippe Colson
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Taoufik Ghrairi, Marie Kempf

Mots clés

Mots clés contrôlés

Infections à Acinetobacter

Acinetobacter baumannii

épidémiologie

Libye

Régulation de l'expression des gènes bactériens

métabolisme

bêta-Lactamases

Bactéries à Gram négatif

Infections bactériennes à Gram négatif

Protéines bactériennes

Mots clés libres

Bacilles à Gram-négatif

Bassin méditerranéen

Isolats cliniques multi-résistants aux β-lactamines

Études épidémiologiques

Études moléculaires des mécanismes de résistance aux β-lactamines

Gram-negative bacilli

Mediterranean basin

Clinical isolates multi-resistant to β-lactams

Epidemiological studies

Molecular studies of the mechanisms of β-lactam resistance

Résumé

L’augmentation et la dissémination de la résistance aux β-lactamines chez les bacilles à Gram négatif, particulièrement les Entérobactéries, les bactéries du genre Pseudomonas et Acinetobacter, représentent un problème majeur de santé publique. Les infections nosocomiales causées par ces bactéries multi-résistantes (BMR) ont conduit à une augmentation de la mortalité, de la morbidité et du coût de traitement. L’utilisation abusive et non contrôlée de ces antibiotiques a grandement contribué à la large diffusion de cette résistance. Ainsi, face à cette préoccupation mondiale et suite à de nombreuses recommandations, plusieurs études épidémiologiques et moléculaires ont été rapportées afin de contrôler et de surveiller la diffusion et la dissémination des BMR. Contrairement à de nombreuses régions dans le monde, il existe peu d’informations concernant la caractérisation moléculaire des gènes de résistance aux β-lactamines des bacilles à Gram négatif isolés en Tunisie et surtout en Libye. C’est dans cette optique que ce projet de Thèse de Doctorat s’articule avec comme objectifs: (i) mettre en évidence la prévalence des bacilles à Gram négatifs multi-résistants isolés aux niveaux des hôpitaux tunisiens et libyens (ii) identifier le support génétique de la résistance aux β-lactamines de ces souches cliniques (iii) étudier la diversité clonale des souches multi-résistantes par typage moléculaire.

The increase and spread of β-lactam resistance in gram negative bacteria especially Enterobacteriaceae, Pseudomonas and Acinetobacter (E.P.A) species have become a major concern worldwide. The hospital-acquired infections caused by MDR bacteria have led to an increase in mortality, morbidity and cost of treatment. The frequent misuse of antibiotic drug has greatly contributed to worldwide dissemination of antibiotics resistance. Front of this worldwide concern, and various recommendations, several epidemiological and molecular studies have been reported in order to control the spread and the dissemination of these MDR. Unlike many parts of the world, there is little information concerning the molecular characterization of the β-lactam resistance genes of Gram-negative bacilli isolated in Tunisia and especially in Libya. Therefore, it is in this context that the project of this thesis was conducted with essential objectives: (i) highlight the prevalence of multi-resistant Gram negative bacilli isolated in Tunisian and Libyan hospitals (ii) identify the genetic support of resistance to β-lactams of these clinical strains (iii) study the clonal diversity of the multi-resistant strains by molecular typing (iii) study the molecular epidemiology of these BMRs in these countries in order to control the decision-making process of the treatment and the rapid identification of epidemics by implementing appropriate control measures for the spread of infections and especially developing new tools and software for the diagnosis and monitoring of potential MDR bacteria in Mediterranean countries.