Thèse soutenue

Mise au point de méthodes de détection d’interaction ligand-macromolécule par RMN du 19F
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Auteur / Autrice : Raphaël Recht
Direction : Bruno KiefferMarat Yusupov
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biophysique et biologie structurale
Date : Soutenance le 23/09/2016
Etablissement(s) : Strasbourg
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire (Strasbourg)
Jury : Président / Présidente : Esther Kellenberger
Examinateurs / Examinatrices : Bruno Kieffer, Marat Yusupov, Esther Kellenberger, Wolfgang Jahnke, José Martins, Martial Piotto
Rapporteurs / Rapporteuses : Wolfgang Jahnke, José Martins

Résumé

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Les interactions biologiques sont régies par des mécanismes complexes, qui mêlent différentes échelles, de temps comme de taille. C’est le cas du ribosome, un complexe nucléoprotéique responsable de la traduction de l’ARNm en protéines, et ce faisant, une cible thérapeutique primordiale. Or la taille du ribosome procaryote 70S (2.4 MDa) rend difficile l’applications des techniques classiques de criblage de ligands. Au cours de ma thèse, j’ai exploré la possibilité d’utiliser la RMN du fluor pour caractériser les interactions entre des ligands et le ribosome procaryote. Cette approche a été motivée par l’apport de nouvelles méthodes de détection pouvant coupler la versatilité de la RMN (Résonance Magnétique Nucléaire) avec les propriétés de l’atome de fluor. L’atome 19F se prête parfaitement à la RMN, avec son rapport gyromagnétique proche du proton et son abondance isotopique naturelle de 100%. De plus, le fluor est bio-orthogonal au Vivant. Enfin, les caractéristiques physico-chimiques du fluor sont bien exploitées dans la pharmacopée (un quart des antibiotiques en possèdent un groupement).