Analyse intégrée de la réponse de la vigne à l'infection par Plasmopara viticola : par l'étude d'un cas de contournement de résistance

Integrated analysis of the grapevine response to Plasmopara viticola infection : through study of breakdown resistance

• Auteur / Autrice : Lise Negrel
• Direction : Didier Merdinoglu, Philippe Hugueney
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie
• Date : Soutenance le 27/05/2016
• Etablissement(s) : Strasbourg
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Santé de la vigne et qualité du vin (Strasbourg)
• Jury : Président / Présidente : Hubert Schaller
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Alain Hehn
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Laurence Godiard, Maria Manzanares-Dauleux

Mots clés

Mots clés contrôlés

Dissertations universitaires

Métabolomique

Plantes -- Métabolites

Résistance aux maladies

Plasmopara viticola

Diagnostic immunologique

Mildiou de la vigne

Mots clés libres

Vigne

Vitis vinifera

Mildiou

Plasmopara viticola

Résistance

Rpv3 métabolomique

Grapevine

Vitis vinifera

Downy mildew

Plasmopara viticola

Résistance

Rpv3 metabolomic

Résumé

Un déploiement optimal de variétés résistantes nécessite une excellente connaissance des relations entre la vigne et P. viticola. Ces connaissances fondamentales pourront ensuite alimenter les stratégies pour le développement de variétés durablement résistantes au vignoble. Bianca est une variété de vigne résistante au mildiou qui possède le gène résistance Rpv3. Cette variété est résistante à la plupart des souches de P. viticola. Cependant, une souche virulente capable de l’infecter a été isolée. Dans ce projet, un pathosystème original, fondé sur la variété Bianca confrontée à une souche avirulente et à une souche virulente de P. viticola, a été utilisé pour obtenir une image complète de l'impact sur la vigne de l'infection par P. viticola en situation compatible et incompatible, en combinant des études de physiopathologie avec des analyses métabolomiques par spectrométrie de masse à haute résolution et par résonance magnétique nucléaire. Parallèlement, l'identification de métabolites et de séquences géniques spécifiques de P. viticola a permis le développement de méthodes de suivi dynamique de l'infection, grâce à la PCR quantitative et à la quantification de lipides caractéristiques de l'agent pathogène.

Optimal deployment of resistant varieties requires an excellent knowledge of the relationship between grapevine and P. viticola. This fundamental knowledge can then feed the strategies for the development of grapevine varieties with sustainable resistance. Bianca is a downy mildew-resistant grapevine variety, due its Rpv3 resistance gene. This variety is resistant to most strains of P. viticola. However, a virulent strain capable of infecting Bianca has recently been isolated. In this project, we use this original pathosystem to obtain a complete picture of the impact P. viticola infection on grapevine, by combining physiopathological studies with metabolomic analyses. In addition, the identification of specific metabolites and gene sequences from P. viticola has allowed the development of original methods for dynamic monitoring of the infection process, through quantitative PCR and quantification of specific lipids.