Thèse soutenue

Identification des circuits biologiques induits par le virus de l'hépatite C et leurs implications dans le développement du carcinome hepatocellulaire
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Auteur / Autrice : Nicolaas Van Renne
Direction : Thomas BaumertMirjam Zeisel
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Virologie : aspects moléculaires et médicaux
Date : Soutenance le 19/04/2016
Etablissement(s) : Strasbourg
Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Strasbourg ; 2000-....)
Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Interactions virus-hôte et maladies hépatiques (Strasbourg)
Jury : Président / Présidente : Luc Dupuis
Rapporteurs / Rapporteuses : Laurence Cocquerel, Christoph Neumann-Haefelin

Résumé

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En combinant un nouveau système de culture cellulaire à partir d'hépatocytes différenciés avec du virus de l’hépatite C (VHC) purifié, nous pouvons induire un profil transcriptomique caractéristique des patients à risque élevé de développer un carcinome hépatocellulaire (CHC). En utilisant ce modèle, nous avons découvert le rôle fonctionnel de l'EGFR comme élément moteur de la signature du risque de développement d'un CHC. De plus, nous avons identifié des gènes candidats impliqués dans le développement du CHC. Pour étudier les maladies du foie in vivo, nous avons caractérisé l'expression des protéines phosphatases dans des biopsies hépatiques de patients infectés par le VHC. Nous avons observé une régulation négative de PTPRD, un suppresseur de tumeur, causé par une augmentation de miR-135a-5p qui cible l'ARNm de PTPRD. Par ailleurs, l'analyse in silico montre que l'expression de PTPRD dans le tissu hépatique est corrélée à la survie chez les patients atteints de CHC.