Analyse génétique de la valeur hybride chez le maïs fourrage dans des dispositifs multiparentaux : détection de QTL et sélection génomique

Genetic analysis of hybrid value for silage maize in multiparental designs : QTL detection and genomic selection

• Auteur / Autrice : Héloïse Giraud
• Direction : Alain Charcosset
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences du vivant
• Date : Soutenance le 22/01/2016
• Etablissement(s) : Université Paris-Saclay (ComUE)
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Agriculture, alimentation, biologie, environnement, santé (Paris ; 2015-....)
• Partenaire(s) de recherche : établissement de préparation de la thèse : Université Paris-Sud (1970-2019)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Génétique quantitative et évolution-Le Moulon (Gif-sur-Yvette, Essonne ; 2002-....)
• Jury : Président / Présidente : Philippe Brabant
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Alain Charcosset, Philippe Brabant, Rex Bernardo, Pascale Leroy, Laurence Moreau, Pierre Carolo, Zulma Gladis Vitezica
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Rex Bernardo, Pascale Leroy

Mots clés

Mots clés contrôlés

Sélection artificielle

Locus à caractère quantitatif

Maïs -- Amélioration génétique

Mots clés libres

Sélection génomique

Maïs

Ensilage

Détection de QTL

Valeur hybride

Genomic selection

Maize

Silage

QTL detection

Hybrid value

Résumé

La sélection génomique offre de nouvelles perspectives en amélioration des plantes pour la sélection de caractères complexes. Le travail proposé porte sur l’évaluation de son intérêt dans le cadre d’un programme de sélection réciproque pour la valeur d’hybrides entre deux groupes génétiques de maïs complémentaires. Il s’appuie sur un dispositif expérimental original constitué de 900 hybrides produits dans un plan factoriel entre deux dispositifs multiparentaux connectés. L’objectif de la sélection est d’améliorer le rendement ensilage des hybrides tout en améliorant leur digestibilité. Une réflexion sur les modèles permettant de prédire la valeur hybride sera conduite et testée sur les données expérimentales et par simulations. Ce travail, conduit en collaboration avec sept sociétés de sélection (au sein de PROMAÏS) devrait permettre d’améliorer les dispositifs de sélection classiques et de produire des hybrides d’intérêt agronomique. Il s’inscrit dans le cadre plus général de l’amélioration pour la valeur en croisement commune à de nombreuses espèces végétales allogames et à certaines espèces animales.

Genomic selection opens new prospects in plant breeding for the selection of complex traits. The proposed study aims to evaluate its efficiency in the context of a reciprocal selection schemes for the hybrid value between two complementary maize groups. The work will rely on an original experimental design including 900 hybrids produced from a factorial between two multiparental connected designs. The selection objective is to increase the hybrids silage yield as well as their digestibility. Several models for the hybrid value prediction will be proposed and tested on the experimental data and by simulations. This study, carried out in close connection with seven plant breeding companies (members of PROMAÏS) will contribute to the improvement of breeding designs and will produce new interesting hybrids. It falls within the general context of the selection for hybrid value which is common to numerous plant allogamous species and animal species.