Identification et étude d'un nouveau mécanisme nucléaire de régulation post-transcriptionnelle par les micro-ARN

Nucleoplasmic post transcriptional gene silencing mediated by microRNAs is controlled by Sfpq

• Auteur / Autrice : Nedra Tekaya Hamouda
• Direction : Michele Trabucchi
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Interactions moléculaires et cellulaires
• Date : Soutenance le 31/03/2016
• Etablissement(s) : Nice
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Nice ; 1992-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre Méditerranéen de Médecine Moléculaire (Nice) - Centre méditérannéen de médecine moléculaire
• Jury : Président / Présidente : Jean-François Tanti
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Michele Trabucchi, Jean-François Tanti, Sébastien Fribourg, Annick Harel-Bellan, Stéphane Audebert, Pascal Barbry
• Jury : Rapporteur / Rapporteuse : Sébastien Fribourg, Annick Harel-Bellan

Mots clés

Mots clés contrôlés

Inactivation génique

Cellules souches

Récepteurs nucléaires (biochimie)

MicroARN

Mots clés libres

Micro-ARN

Régulation nucléaire

Cellules souches

Micro-RNA

Nuclear regulation

Gene silencing

Sfpq

Résumé

Les miARN sont de petits ARN non codant dont la taille varie entre 21-24 nucléotides. Ils jouent un rôle de régulateurs post-transcriptionnels en utilisant leur complémentarité de séquence avec l’ARN messager (ARNm) cible afin d’induire sa répression. Grâce à la protéine Argonaute 2 (Ago2) dans laquelle les miARN sont incorporés formant ainsi le complexe miRISC, des cofacteurs sont recrutés afin d’induire la dégradation ou le blocage de la traduction de l’ARNm cible. Initialement connus pour réguler leurs cibles dans le cytoplasme, les miARN sont de plus en plus décrits comme étant des régulateurs de l’expression génique au niveau nucléaire. Dans ce travail, nous avons démontré la présence, au sein du noyau, d’un nouveau mécanisme de régulation post-transcriptionel par les miARN dont les facteurs majeurs sont Sfpq et Pspc1

Micro-RNA, nuclear regulation, gene silencing, SfpqThere is a growing body of evidence about the presence and the activity of the miRISC in the nucleus of mammalian cells. Here we show by quantitative proteomic analysis that Ago2 interacts with the complex formed by Sfpq, Pspc1 and NonO in a RNA-dependent fashion. Sfpq mediates the interaction between miRISC with Pspc1 and NonO in the nucleoplasm. By HITS-CLIP coupled with transcriptomic analysis, we demonstrated that Sfpq specifically controls the downregulation of a subset of crucial let-7a-target mRNAs in stem cells, including Lin28a, Prtg, and Igf2bp1. Sfpq directly binds to specific sequence in the 3'UTR to promote the recruitment of selected nucleoplasmic miRNAs and triggers the decay, as we show for Lin28a mRNA. These results extend the miRNA-mediated post-transcriptional gene silencing into the nucleus and indicate that a dual strategy