Coinfections, superinfections et interférences virales des VIH - 1 au niveau cellulaire

Coinfections, superinfections and HIV-1 interferences at the cellular level

• Auteur / Autrice : Azaria Remion
• Direction : Fabrizio Mammano, Sentob Saragosti
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Virologie
• Date : Soutenance en 2015
• Etablissement(s) : Sorbonne Paris Cité
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Biochimie, biothérapies, biologie moléculaire, infectiologie (Paris2009-2013)
• Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Université Paris Diderot - Paris 7 (1970-2019)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Odds ratio

Cytométrie de flux

Interférence virale

Co-infection

complications

Infections à VIH

VIH-1 (Virus de l'Immunodéficience Humaine de type 1)

Résumé

L'importance de la recombinaison génétique dans l'évolution du VIH-1 est telle qu'elle pourrait constituer une étape à part entière du cycle infectieux du virus. Ce phénomène n'est possible qu'à la suite d'une double infection cellulaire. Cependant, l'infection d'une cellule par un virus VIH-1 réduit sa susceptibilité à se faire réinfecter par un phénomène dit d'interférence virale. Nos objectifs étaient de caractériser la dynamique de la susceptibilité cellulaire aux doubles infections VIH-1 ainsi que d'identifier les possibles modifications de ce paramètre en fonction du délai de double infection à la recherche des différents acteurs à l'origine de ces variations. Pour réaliser les doubles infections (coinfections et superinfections), in vitro, nous avons utilisé deux types de particules virales VIH-1 chacune possédant une protéine rapportrice différente, la protéine GFP et la protéine HSA. Ces particules virales nous ont permis, par cytométrie de flux, de suivre les distributions de ces deux infections en fonction du délai de temps entre les deux évènements. Nous proposons une approche originale pour quantifier certains des mécanismes induits par différents acteurs de l'interférence virale HIV-HIV après la 1ère infection. Alors que seule l'expression de Rev au sein des cellules infectées est nécessaire et suffisante pour fortement diminuer la distribution des superinfections, l'expression d'autres gènes viraux permet d'appliquer une restriction virale supplémentaire. Nous démontrons également qu'en absence de ces mécanismes viraux indépendants mais complémentaires, les cellules infectées conserveraient dans le temps une susceptibilité accrue aux doubles infections.

The importance of genetic recombination in the evolution of HIV-1 is such that it could be a separate step in the infection cycle of the virus. This phenomenon is possible only after a double cellular infection. However, infection of a cell by an HIV-1 virus reduces its susceptibility to be reinfected by a phenomenon called viral interference. Our objectives were to characterize the dynamics of cell susceptibility to HIV-I infection doubles and identify possible changes of this parameter based on the dual infection time to research the different actors at the origin of these variations. To achieve the dual infections (co-infections and superinfection), in vitro, we used two types of HIV-1 viral particles each having a different rapporteur protein, GFP and HSA protein. These virus particles allowed us, by flow cytometry, follow the distributions of these two infections versus time delay between the two events. We propose a novel approach to quantify some of the mechanisms induced by different actors of the HIV-viral interference after the first HIV infection. While only the expression of Rev within infected cells is necessary and sufficient to significantly reduce the distribution of superinfection, the expression of other viral genes used to apply an additional viral restriction. We also demonstrate that in the absence of these independent but complementary viral mechanisms, infected cells retain over time an increased susceptibility to infections doubles.