Régulation transcriptionnelle et post-transcriptionnelle des gênes LAT et ICP4 du virus de la maladie de Marek

Transcriptional and post-transcriptional regulation of LAT and ICP4 genes of Marek's disease virus

• Auteur / Autrice : Perrine Rasschaert
• Direction : Sylvie Laurent
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences de la vie, spécialité Virologie
• Date : Soutenance le 08/04/2015
• Etablissement(s) : Tours
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Centre-Val de Loire)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte (Tours)
• Jury : Président / Présidente : Stéphane Bertagnoli
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Marc Clastre
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Michel Georges, Didier Auboeuf

Mots clés

Mots clés contrôlés

ARN -- Modifications posttranscriptionnelles

Transcription génétique

Épissage alternatif

ARN non codants

Virus de la maladie de Marek

Maladie de Marek

Mots clés libres

Herpesvirus de la maladie de Marek

ARN long non codant LAT

ICP4

MicroARN

Épissage alternatif

Régulation transcriptionnelle

Marek’s disease herpesvirus

Long non coding RNA LAT

ICP4

MicroRNA

Alternative splicing

Transcriptional regulation

Résumé

Le virus de la maladie de Marek (MDV) est un virus oncogène responsable des lymphomes T chez les poulets. L´infection par ce virus est divisée en une phase lytique dépendante de l´expression du gène très précoce ICP4 et une phase latente, caractérisée par l´expression de l’ARN long non codant LAT localisé en antisens. Nous avons montré que l’expression différentielle des miARN du cluster mdv1-miR-M8-M10 était directement corrélée à l’épissage alternatif de l’intron 1 du LAT et plus particulièrement à la biogenèse par le splicéosome du premier mirtron viral. La présence du mirtron mdv1-miR-M6 au milieu du cluster est associée à une cinétique d’expression des miARN. En parallèle, nous avons identifié deux promoteurs alternatifs de type Sp1, quatre signaux poly-A et trois exons associés à la régulation de la transcription du transcrit ICP4. Nous avons prédits cinq isoformes potentielles pour la protéine ICP4 et avons pu observer par immunodétection que la protéine était exprimée principalement dans le cytoplasme des cellules infectées en phase lytique ou de réactivation.

The Marek disease virus (MDV) is an oncogenic herpesvirus responsible of T-cell lymphoma in chicken. MDV infections are divided into a lytic phase, depending on the expression of immediate early gene like ICP4, and a latent phase characterized by the expression of the long non-coding RNA LAT localized in antisense. In this study, we have shown the differential expression of the cluster of miRNA mdv1-miR-M8-M10 was directly correlated with the alternative splicing of LAT’s intron 1 and more specifically with the first viral mirtron biogenesis by the spliceosome. The location of the mirtron mdv1-miR-M6 inside of the cluster is associated with a two-step biogenesis of the miARN of the cluster. On the other hand, we have identified a dual promoter that responded to Sp1, four poly-A signals and three exons that are responsible of transcriptional regulation of ICP4 transcript. We also have predicted five potential isoproteines for ICP4 and were able to observe by immunodetection that ICP4 was mainly expressed in the cytoplasm of infected cells during the lytic phase or the reactivation one.