Thèse de doctorat en Biologie. Immunologie
Sous la direction de Xavier Saulquin et de Marc Bonneville.
Soutenue en 2015
à Nantes , dans le cadre de École doctorale Biologie-Santé Nantes-Angers , en partenariat avec Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Intégrée Nantes Angers (laboratoire) , Nantes Université. Pôle Santé. UFR Médecine et Techniques Médicales (Nantes) (autre partenaire) et de Université Nantes-Angers-Le Mans - COMUE (2009-2015) (autre partenaire) .
Le jury était composé de Xavier Saulquin, Marc Bonneville.
Les rapporteurs étaient Victor Appay, Bernard Maillère.
L'étude des mécanismes contribuant au remodelage du répertoire lymphocytaire T naïf périphérique chez l'homme constitue un prérequis pour l'identification de marqueurs prédictifs de la réponse immune dans divers contextes physiopathologiques (anti-tumoral, anti-viral, greffe) et vaccinaux. Au cours de ce travail de thèse, nous avons étudié les paramètres influençant quantitativement et qualitativement des répertoires T spécifiques de peptides viraux, tumoraux, endogènes restreints par la molécule HLA-A*02:01 (A2) au cours de la sélection thymique. Par ailleurs, nous avons tenté de mieux caractériser le répertoire alloréactif restreint par cet allèle. Grâce à une stratégie basée sur l'enrichissement magnétique de cellules p-CMH-spécifiques permettant de détecter des populations rares, nous avons analysé dans les compartiments thymiques et en périphérie des LT spécifiques d'antigènes A2-restreints chez des individus exprimant ou non le A2. Nous avons aussi mis en place une banque de 42 complexes recombinants peptides endogènes-A2 afin d'étudier le répertoire alloréactif chez des individus A2- sains ou greffés avec mismatch A2. Nos résultats indiquent que le répertoire T est intrinsèquement biaisé vers la reconnaissance des p-CMH et que la capacité pour un complexe donné, à être reconnu par le répertoire T avant sélection joue un rôle important sur la taille du répertoire T périphérique spécifique de ce p-CMH. D'autre part, la présence de l'allèle HLA de restriction semble avoir un rôle majeur dans la qualité de ces répertoires en permettant d'éliminer des cellules présentant une forte crossréactivité vis-à-vis de peptides endogènes retrouvées dans un contexte alloréactif.
The study of TCR/p-CMH I interactions during thymic selection and analyse of the alloreactive T cell repertoire restricted by HLA-A*02:01
The study of mechanisms that contribute to the shaping of the peripheral naïve T cell repertoire in humans is a prerequisite for identifying predictive clues of an efficient immune response in a variety of physiopathological (anti-viral and anti-tumor responses, graft rejection) and vaccinal situations. In this thesis, we investigated the parameters influencing the quantity and quality of T cell repertoires restricted by HLA-A*02:01 (A2) during thymic selection. We also tried to better characterize the alloreactive T cell repertoire restricted by this allele. Through a strategy based on the magnetic enrichment of p-MHC-specific cells allowing the detection of scarce populations, T cells specific for various HLA-A2 restricted tumor, viral or self-epitopes were analysed in both thymic and peripheral compartments of individuals expressing or not this allele. We have also set up a bank of 42 self-peptides-A2 recombinant complexes to study the alloreactive T cell repertoire in A2-negative healthy individuals or HLA-A2-mismatched grafted patients. Our results indicate that the TCR repertoire is intrinsically biased toward p-MHC recognition and that the capacity of a given p-MHC complex to be recognized by the T cell repertoire before selection strongly impacts on the size of the peripheral repertoire specific for this particular p-MHC complex. Moreover, the expression of the MHC-restricting allele seems to play a major qualitative role for these repertoires as it allows the elimination of cells presenting high crossreactivity for self peptides which can be found in alloreactive contexts.