Contribution à la prévention des risques liés à l’anesthésie par la valorisation des informations hospitalières au sein d’un entrepôt de données

Contributing to preventing anesthesia adverse events through the reuse of hospital information in a data warehouse

• Auteur / Autrice : Antoine Lamer
• Direction : Régis Logier, Benoît Vallet
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biostastistiques, informatique médecine et technologies de communication
• Date : Soutenance le 25/09/2015
• Etablissement(s) : Lille 2
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Biologie-Santé (Lille ; 2000-....)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Centre d'Etudes et de Recherche en Informatique Médicale (Lille) - Centre d'Etudes et de Recherche en Informatique Médicale
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Régis Logier, Benoît Vallet

Mots clés

Mots clés contrôlés

Systèmes d'information hospitaliers

Qualité des soins de santé

Plan de recherche

Dissertations universitaires

Anesthésie

Soins médicaux -- Qualité -- Contrôle

Réanimation

Entrepôts de données

Mots clés libres

Qualité des données

Entrepôt de données

Qualité des soins

Data cleaning

Data processing

Data warehouse

Résumé

Introduction Le Système d'Information Hospitalier (SIH) exploite et enregistre chaque jours des millions d'informations liées à la prise en charge des patients : résultats d'analyses biologiques, mesures de paramètres physiologiques, administrations de médicaments, parcours dans les unités de soins, etc... Ces données sont traitées par des applications opérationnelles dont l'objectif est d'assurer un accès distant et une vision complète du dossier médical des patients au personnel médical. Ces données sont maintenant aussi utilisées pour répondre à d'autres objectifs comme la recherche clinique ou la santé publique, en particulier en les intégrant dans un entrepôt de données. La principale difficulté de ce type de projet est d'exploiter des données dans un autre but que celui pour lequel elles ont été enregistrées. Plusieurs études ont mis en évidence un lien statistique entre le respect d'indicateurs de qualité de prise en charge de l'anesthésie et le devenir du patient au cours du séjour hospitalier. Au CHRU de Lille, ces indicateurs de qualité, ainsi que les comorbidités du patient lors de la période post-opératoire pourraient être calculés grâce aux données recueillies par plusieurs applications du SIH. L'objectif de se travail est d'intégrer les données enregistrées par ces applications opérationnelles afin de pouvoir réaliser des études de recherche clinique.Méthode Dans un premier temps, la qualité des données enregistrées dans les systèmes sources est évaluée grâce aux méthodes présentées par la littérature ou développées dans le cadre ce projet. Puis, les problèmes de qualité mis en évidence sont traités lors de la phase d'intégration dans l'entrepôt de données. De nouvelles données sont calculées et agrégées afin de proposer des indicateurs de qualité de prise en charge. Enfin, deux études de cas permettent de tester l'utilisation du système développée.Résultats Les données pertinentes des applications du SIH ont été intégrées au sein d'un entrepôt de données d'anesthésie. Celui-ci répertorie les informations liées aux séjours hospitaliers et aux interventions réalisées depuis 2010 (médicaments administrées, étapes de l'intervention, mesures, parcours dans les unités de soins, ...) enregistrées par les applications sources. Des données agrégées ont été calculées et ont permis de mener deux études recherche clinique. La première étude a permis de mettre en évidence un lien statistique entre l'hypotension liée à l'induction de l'anesthésie et le devenir du patient. Des facteurs prédictifs de cette hypotension ont également étaient établis. La seconde étude a évalué le respect d'indicateurs de ventilation du patient et l'impact sur les comorbidités du système respiratoire.Discussion The data warehouse L'entrepôt de données développé dans le cadre de ce travail, et les méthodes d'intégration et de nettoyage de données mises en places permettent de conduire des analyses statistiques rétrospectives sur plus de 200 000 interventions. Le système pourra être étendu à d'autres systèmes sources au sein du CHRU de Lille mais également aux feuilles d'anesthésie utilisées par d'autres structures de soins.

Introduction Hospital Information Systems (HIS) manage and register every day millions of data related to patient care: biological results, vital signs, drugs administrations, care process... These data are stored by operational applications provide remote access and a comprehensive picture of Electronic Health Record. These data may also be used to answer to others purposes as clinical research or public health, particularly when integrated in a data warehouse. Some studies highlighted a statistical link between the compliance of quality indicators related to anesthesia procedure and patient outcome during the hospital stay. In the University Hospital of Lille, the quality indicators, as well as the patient comorbidities during the post-operative period could be assessed with data collected by applications of the HIS. The main objective of the work is to integrate data collected by operational applications in order to realize clinical research studies.Methods First, the data quality of information registered by the operational applications is evaluated with methods … by the literature or developed in this work. Then, data quality problems highlighted by the evaluation are managed during the integration step of the ETL process. New data are computed and aggregated in order to dispose of indicators of quality of care. Finally, two studies bring out the usability of the system.Results Pertinent data from the HIS have been integrated in an anesthesia data warehouse. This system stores data about the hospital stay and interventions (drug administrations, vital signs …) since 2010. Aggregated data have been developed and used in two clinical research studies. The first study highlighted statistical link between the induction and patient outcome. The second study evaluated the compliance of quality indicators of ventilation and the impact on comorbity.Discussion The data warehouse and the cleaning and integration methods developed as part of this work allow performing statistical analysis on more than 200 000 interventions. This system can be implemented with other applications used in the CHRU of Lille but also with Anesthesia Information Management Systems used by other hospitals.