Etude d'association génétique et analyse de gènes candidats différentiellement exprimés au cours de la polyarthrite rhumatoïde

Genetic association study and analysis of differentially expressed genes in rheumatoid arthritis

• Auteur / Autrice : Mostefa Fodil
• Direction : Elisabeth Petit-Teixeira, Abdallah Boudjema
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie cellulaire et moléculaire
• Date : Soutenance le 12/05/2015
• Etablissement(s) : Evry-Val d'Essonne en cotutelle avec Université des Sciences et de la Technologie d'Oran Mohamed-Boudiaf (Algérie)
• Ecole(s) doctorale(s) : Ecole doctorale des Génomes aux organismes (Versailles ; 2000-2015)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire de recherche européen pour la polyarthrite rhumatoïde (Evry, Essonne)
• Jury : Président / Présidente : Nadhira Saidi-Mehtar
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : François Cornélis
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Catherine Boisson-Vidal, Amel Berrebbah-Alioua

Mots clés

Mots clés contrôlés

Polymorphisme génétique

Transcriptome

Mots clés libres

Gènes candidats

PTPN22

PGLYRP1

Résumé

Nous nous sommes intéressés à l’étude génétique de la PR, maladie auto-immune, chronique et inflammatoire affectant principalement les articulations et entraînant leur destruction. La PR est une pathologie multifactorielle où le système HLA semble être le principal, mais non unique, facteur de prédisposition génétique.Pour la première partie de notre étude, nous nous sommes intéressés à la recherche d’association avec la PR, dans la population Algérienne, pour des polymorphismes de gènes déjà confirmés dans d’autres populations. Cette approche a permis d’établir une preuve solide d’association pour les deux SNPs les plus importants PTPN22rs2476601 et STAT4rs7574865. De plus amples études avec des échantillons élargis et l’inclusion de nouveaux polymorphismes de gènes candidats permettraient d’établir de nouvelles preuves d’association génétique avec la PR dans la population Algérienne.Dans un second temps, nous nous sommes intéressés à l’analyse familiale d’association génétique de polymorphismes de gènes présentant un différentiel d’expression dans la PR. Cette partie de l’étude représente un complément d’information pour la compréhension du fonctionnement de ces gènes et de leur implication dans la PR. Ce travail d’analyse d’association génétique a été complété par l’étude de la relation entre les génotypes des SNPs étudiés et le taux d’expression des gènes considérés.Les polymorphismes d’intérêts mis en évidence au cours de cette thèse représentent des cibles de choix pour l’analyse conjointe de la PR dans les deux populations algérienne et française en vu d’une comparaison ethnique des différents facteurs de prédisposition génétique à la PR.

We are interested in genetic study of rheumatoid arthritis “ra”, an autoimmune and chronic inflammatory disease affecting mainly joints and involving their destruction.“ra” is a multi-factor pathology in which the hla region seems to be the main but not unique genetic factor predisposition.for the first part of our study, we are interested in search of association with “ra” in the algerian population for genes polymorphisms already confirmed in other populations. this approach has allowed us establishing an association with solid evidence for the two most important snps ptpn22rs2476601 and stat4rs7574865. further studies with expanded samples and the inclusion of new genes polymorphisms candidates could establish new evidence of genetic association with pr population in algeria.in a second time, we are interested to family association analysis of genetic polymorphism gene having differential expression in pr. this part of the study represents supplementary information for understanding genes these operating and their involvement in pr. this work analysis genetics association was supplemented by the study of relationship between genotypes of snps studied and the rate of gene expression considered.polymorphisms of interest shown during this study represent good targets for a combined analysis of “ra” in both french and algerian populations to establish an ethnic comparison of various factors for genetic predisposition to “ra”.