Cartographie fine de QTL pour des caractères d’intérêt pour la filière caprine

par Cyrielle Maroteau

Thèse de doctorat en Génétique moléculaire

Sous la direction de Gwenola Tosser et de Rachel Rupp.

Soutenue en 2014

à Toulouse 3 .

  • Titre traduit

    Fine mapping of QTL for traits of interest for the dairy goat industry


  • Pas de résumé disponible.


  • Résumé

    Dans un contexte où l’image du lait s’érode, de nouveaux caractères apparaissent a priori comme des critères qualité les plus regardés par les consommateurs. Les objectifs principaux de la thèse étaient d’étudier de nouveaux caractères d’intérêts impactant la qualité du lait de chèvre, qui seront les futurs enjeux de la filière. Le comptage de cellules somatiques (caractère prédictif de la résistance aux mammites) et la composition fine en acides gras du lait ont constitué les caractères centraux de cette étude. Dans un premier temps, l’étude du déterminisme génétique de la composition en AG permise par le développement d’équations de prédictions appliqué aux spectres MIR issues du contrôle laitier a été menée. Par le développement de la puce caprine haut débit contenant 53 347 SNP les premières analyses QTL caprines sur les caractères laitiers de morphologies ainsi que les nouveaux caractères d’intérêt ont été réalisées. Le génotypage de 2 254 filles issues de 20 mâles d’IA a permis de montrer l’existence de nombreuses régions chromosomiques impactant les différents caractères étudiés. Différents éléments, tels que l’existence d’un fort QTL pour le TB et la plupart des AG en aval de la région du gène DGAT1, ainsi que l’existence d’une mutation causale bovine liée à un QTL impactant le TB ou encore à des modifications de la composition fine en AG en race bovine désignent ce gène comme un fort candidat positionel et fonctionnel. Ainsi, une étude fine de caractérisation complète de la séquence du gène aisni que de la recherche de polymorphismes a conduit à l’identification de 2 SNP exoniques responsables de substitutions non conservatives de la séquence protéique, en total déséquilibre de liaison avec les SNP des QTL détéctés. Au niveau phénotypique, les chèvres Alpine et Saanen présentant la mutation R396W, sont caractérisées par un TB et une composition en AGS à courte chaine plus faible et une composition en AGS à longue chaine et AGI (W3, W6) plus forte. L’hypothèse retenue serait une modification de la conformation de la protéine proche de son site actif entrainant une diminution de son activité ainsi qu’une modification de sa sensibilité aux AG. Jusqu’à présent, dans l’espèce caprine, toutes mutations identifiées influençant la composition du lait et en particulier le TP concernaient les caseines. Cette thèse met en évidence de nouvelles mutations impactant la composition fine du lait et en particulier le TB et le profil en matière grasse du lait de chèvre.

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Informations

  • Détails : 1 vol. (185 p.)
  • Notes : Thèse confidentielle jusuq'au 25/02/2024
  • Annexes : Bibliogr. p. 116-130

Où se trouve cette thèse\u00a0?

  • Bibliothèque : Université Paul Sabatier. Bibliothèque universitaire de sciences.
  • Non disponible pour le PEB
  • Cote : 2014 TOU3 0145
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